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一种分析细胞命运转换关键转录因子的方法及系统

摘要

本发明公开了一种分析细胞命运转换关键转录因子的方法及系统,方法包括对细胞进行转录组测定得到基因表达谱并进行比对,得到差异基因;对细胞进行扰动并进行转录组测定得到基因表达谱矩阵;从基因表达谱矩阵中提取转录因子表达谱生成第一矩阵;从基因表达谱矩阵中提取差异基因表达谱生成第二矩阵;根据转录因子结合位点信息生成第三矩阵;得到正则化模型并计算得到关键转录因子预测结果。本发明通过与目标细胞相关的转录因子信息、差异基因信息及转录因子结合位点信息构建正则化模型,并通过正则化模型对影响细胞命运转换的关键转录因子进行预测,相较于现有技术可以有效提高对关键转录因子的预测准确度。本发明可以广泛应用于生物技术领域。

著录项

  • 公开/公告号CN112820353A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-05-18

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中山大学;深圳大学;

    申请/专利号CN202110086884.7

  • 发明设计人 覃静;胡耀华;

    申请日2021-01-22

  • 分类号G16B25/10(20190101);G16B30/10(20190101);G16B5/00(20190101);C12Q1/6869(20180101);

  • 代理机构44205 广州嘉权专利商标事务所有限公司;

  • 代理人谭英强

  • 地址 510275 广东省广州市海珠区新港西路135号

  • 入库时间 2023-06-19 11:02:01

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-10-03

    授权

    发明专利权授予

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