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一种检测基因编辑效率和基因编辑模式的方法及其应用

摘要

本发明涉及一种检测基因编辑效率和基因编辑模式的方法及其应用,属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤:S1,提取样本基因组DNA,对待测区设计引物并扩增;S2,构建文库进行高通量测序,并对数据进行过滤、拆分和拼接,得到待测区序列;S3,将待测区序列与基因组参考序列比对,得到每个样本的基因编辑效率和模式;S4,对处理组样本和对照组样本的基因编辑效率作显著性分析并输出校正后结果。与现有技术相比,本发明简化了基因文库构建过程,加快了数据分析处理的速度,提高了基因编辑效率检测的经济性、敏感性、特异性和准确性,也提供了对基因编辑模式的多维度评估。

著录项

  • 公开/公告号CN112322714A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-02-05

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海交通大学;

    申请/专利号CN202011218400.1

  • 申请日2020-11-04

  • 分类号C12Q1/6869(20180101);G16B30/10(20190101);

  • 代理机构31225 上海科盛知识产权代理有限公司;

  • 代理人褚明伟

  • 地址 200240 上海市闵行区东川路800号

  • 入库时间 2023-06-19 09:49:27

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-04-07

    发明专利申请公布后的驳回 IPC(主分类):C12Q 1/6869 专利申请号:2020112184001 申请公布日:20210205

    发明专利申请公布后的驳回

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