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一种基于matK基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库

摘要

一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库,所述方法包括步骤:获取含有matk基因的原始序列数据文件;提取所述原始序列数据文件中的物种注释信息;将所述物种注释信息整合至所述matK基因上,以得到matK序列;对所述matk序列进行质量控制;根据所述matk序列之间的相似性进行聚类;根据聚类结果构建所述数据库。本申请提供的一种基于matk基因的未知植物物种识别数据库的构建方法及数据库优点为:(1)检测通量高;(2)高灵敏度和选择性;(3)该方法所构建的数据库覆盖面广、数据质量高、信息全面;(4)可以利用生物信息学方法在物种的水平上确定未知物种。

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  • 2022-06-17

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