采用ddPCR方法鉴定PML‑RARα融合基因中的Brc3亚型

摘要

本发明公开了一种采用ddPCR方法鉴定PML‑RARα融合基因中的Brc3亚型，该ddPCR方法包括提取血液中的RNA并进行QC评估和RNA反转录cDNA并进行QC评估。本发明针对常见的Brc3型，设计检测fusion探针，引物针对fusion两侧序列进行扩增；将RARΑ基因作为内参，设计Ref探针，引物仅扩增RARΑ基因。本发明中的ddPCR检测方法PML‑RARα融合bcr3亚型可达0.01%的丰度，远超RT‑PCR的0.1%，重复性好，无假阳性；在低AF的情况下，建议样本投入量增加，或重复多个平行操作。由于该技术的高灵敏度，因此可应用于疾病的早期确诊、动态监测和防治复发。