下一代基因组测序方法

摘要

本发明公开了增强的用于通过半导体测序，优选地离子激流测序快速和成本有效地分析微生物序列的方法。所述方法提供多个基因组的多个区域(例如基因)的全长分析。这些方法鉴定导致赋予对抗生素或其它化合物的抗性或敏感性的特定基因的基因突变。特定生物体的多个不同种类、菌株和/或血清型被快速和有效地筛查并且突变随同生物体的完整基因组一起被鉴定。通过选择产生具有跨越整个基因组的序列的扩增子的相似大小和GC含量的引物对，通过离子激流方法学分析的单个PCR反应可测定完整基因组的序列。所述方法可用于测序病毒物质例如流感病毒和细菌物质例如结核病细菌的基因组。