宏基因组下一代测序用于病原体检测的现状及展望

摘要

所有的病原体都含有DNA或RNA基因组,这使得基因测序成为一独特的病原体检测方法.自2004年以来,高通量测序(也称作下一代测序next generation sequencing,NGS)的成本已经降低了几个数量级,而且它已经发展成为一个能够检测患者临床样本中的微生物,并对其进行分类的技术平台.本文综述了非靶向宏基因组测序技术在感染性疾病临床诊断中的应用,特别是在传统诊断方法有局限性的领域.综述内容包括下一代测序在病原体检测的优势、宏基因测序的临床应用、宏基因检测的局限性及可能的解决方案.