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潜在EZH2小分子抑制剂及其合成方法

摘要

本发明公开了一种潜在EZH2小分子抑制剂及其合成方法。其合成方法的具体步骤如下:①将5?巯基?1?苯基四氮唑和4?氯乙酰乙酸乙酯在强碱作用下反应得到第一中间体;②将第一中间体在强碱作用下和盐酸胍反应得到第二中间体;③将第二中间体和异氰酸酯类或者异硫氰酸酯类化合物反应,生成目标化合物。本发明分离过程简单,不需要柱层析分离,步骤简单,方便进行工业化生产。本发明合成的目标化合物有很好的EZH2抑制活性,为恶性肿瘤药物的研发提供了一类新的小分子结构,这类小分子结构具有多样性,进一步的研究有助于开它的药用价值。

著录项

  • 公开/公告号CN105777718A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2016-07-20

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海应用技术学院;

    申请/专利号CN201610269745.7

  • 发明设计人 姚志艺;张晓攀;

    申请日2016-04-27

  • 分类号C07D403/12(20060101);A61K31/513(20060101);A61P35/00(20060101);

  • 代理机构31253 上海精晟知识产权代理有限公司;

  • 代理人杨军

  • 地址 200235 上海市徐汇区漕宝路120-121号

  • 入库时间 2023-06-19 00:06:42

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-04-04

    未缴年费专利权终止 IPC(主分类):C07D 403/12 专利号:ZL2016102697457 申请日:20160427 授权公告日:20190319

    专利权的终止

  • 2019-03-19

    授权

    授权

  • 2016-12-07

    实质审查的生效 IPC(主分类):C07D403/12 申请日:20160427

    实质审查的生效

  • 2016-07-20

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明属于医药化工技术领域,尤其涉及EZH2小分子抑制剂及其合成方法。

背景技术

在过去的几年,表观遗传修饰,如DNA的甲基化、组蛋白的甲基化和乙酰化已经显 示出对肿瘤的治疗有着良好的前景。研究发现,在血液性疾病和实体瘤中,如霍奇金病、非 霍奇金瘤、前列腺癌、乳腺癌、咽喉癌,都发现了EZH2的过表达,这表明EZH2的过表达与肿瘤 的产生及恶化都有着紧密的联系。因此,很多研究人员将其列为一个治疗癌症的重要靶点, 开发相应的抑制剂。这几年里,已经有几个有效的药物被用作临床抗肿瘤新药,如5-氮杂胞 苷,5-氮-2-脱氧胞苷,和GSK126。进一步的研究发现,组蛋白的甲基化是一个高度可逆的过 程,它与多个肿瘤的发生和发展都有着紧密联系。GSK126是第一个进入临床的组蛋白甲基 化抑制剂,并取得了良好的效果。所以,对于EZH2的深入研究就变得十分的必要,只有更全 面的了解EZH2的结构和生物功能,才能开发出更多高效、高选择性的抑制剂,为恶性肿瘤的 治疗带来新的希望。

在对PRC2的研究更加的深入后,几种潜在的EZH2抑制剂正逐渐出现在人们的视野 中。这些抑制剂中,DZNep可以通过和H3K27me3相互作用来抑制EZH2的表达,这样通过间接 的作用就可以达到使肿瘤细胞被抑制的目的。DZNep干扰S-腺苷-L-同型半胱氨酸水解酶的 新陈代谢,这样就降低了细胞的生存时间和能力,进而间接的抑制甲基化反应。DZNep诱导 细胞凋亡能力与抑制PRC2的途径有着紧密的关系,虽然确切的机制尚未能够研究清楚。此 外,已有文献报道,DZNep和组蛋白去乙酰酶抑制剂是互相作用的。同时,它还与激活沉默基 因的DNA甲基转移酶抑制剂相互协作。作为一个抗病毒化合物,DZNep在人体内的毒性很小。 同时,它在癌细胞的表观遗传途径中也有着很重要的作用,所以它可能是一种有前景的抗 癌候选药物。

在过去几年里的测试,发现这些小分子有很好的选择性,并且对特定细胞的抑制 活性也很高。不像其他类的一些小分子,同时对很多的细胞都有抑制的效果,没有很好的选 择性,达不到杀死特定恶性肿瘤细胞的目的。近期,通过研究发现,淋巴瘤中的EZH2都是高 度表达的,所以要抑制住EZH2的过表达,这样可以使淋巴瘤不会继续的增殖和恶化。研究人 员在前列腺癌和骨髓癌中也观察到EZH2发生了突变和失活。为此,研究人员开发了一些抑 制剂,它可以与酶蛋白相互作用,占用SAM的结合位点,再来和SAM竞争,这样EZH2的高表达 就可以得到有效的抑制,通过这个理念,从而开发出有效的高选择性竞争性抑制剂。

通过PRC2复合物的高通量生物筛选实验,来确定EZH2甲基转移酶的活性。几个有 潜力的抑制小分子已经被筛选出来。虽然活性位点的结构还没有确定,但保守域SET结构显 示了两个基本的结合口袋:一个是用于SAM的甲基供体,另一个是用于Lys27的基质。在人体 中已经发现了50多个SET结构域蛋白,所以抑制剂对EZH2中的SET结构域的选择变得很重 要。

在2012年年底,几个SAM的竞争型抑制剂已经被发现,化合物EPZOO5687对EZH2的 选择性与另外的15个PMTs相比,超过500倍。EPZ005687还可以抑制EZH2上的Y641和A677突 变引起的H3K27甲基化,发现该化合物可以有选择性的杀死由EZH2突变引起的淋巴瘤细胞。

EI1是Novartis发现的一个EZH2的抑制剂小分子,它表现出很高的选择性和抑制 率。EI1可以激活PRC2的目标基因,使EZH2失去H3K27的甲基化功能。同时在细胞测试中,EI1 在EZH2的野生型和Y641的突变出有着很高的抑制活性。在B细胞淋巴瘤中,对EZH2的Y64突 变抑制可以减少细胞的扩散与凋亡,缩短细胞的周期阻滞。

在这些抑制剂中,最有潜力的是GSK126,它的抑制效果突出,IC50达到纳摩级别。 它对EZH2的选择性是对20多种人体含有或不含有SET结构域甲基转移酶选择性的1000多 倍,也超过对EZH1选择性的150倍,GSK126能够有效的抑制扩散在DLBCL细胞株的EZH2突变 体。更重要的是,在动物实验中GSK126也有很好的细胞瘤抑制效果。EZH2的超表达与肿瘤的 恶化密切相关,GSK126为判断EZH2的表达是否是肿瘤发展的所需条件提供了参考。

总的说来,PRC2作为转录因子和基因活化子的功能被用来作为探索药物的基础。 尽管目前还没有批准临床或治疗的化合物出现,应做出更多的努力来开发EZH2的甲基转移 酶抑制剂。EZH2作为一个抗肿瘤的新靶点,进一步的发现和设计EZH2的抑制剂是十分必要 的,可以为肿瘤的治疗提供更多的方法。

发明内容

为了克服现有技术的不足,本发明的目的在于提供一类潜在EZH2小分子抑制剂及 其合成方法。本发明通过计算机药效团模拟筛选出了好的分子结构,合成了活性好的小分 子,为恶性肿瘤的治疗提供一些参考。

本发明提供了一种潜在EZH2小分子抑制剂结构,进一步的设计了有效的合成路 线,并设计提供了一种关键的中间体。通过关键中间体的合成,进一步合成目标分子。

本发明的技术方案具体介绍如下。

本发明提供一种潜在EZH2小分子抑制剂,其具有通式(1)所示结构:

其中:R1为氧或硫,R2选自苯基、取代苯基、苯甲酰基或者萘基中任一种;R2为氧或 硫。

上述式(1)中,R1为氧或硫,R2选自苯基、4-卤素苯基、4-卤代烷基苯基、苯甲酰基或 者萘基中任一种;R2为氧或硫。

本发明的潜在EZH2小分子抑制剂,其合成中间体具有通式(2)所示结构:

本发明还提供一种潜在EZH2小分子抑制剂的合成方法,具体步骤如下:

①将5-巯基-1-苯基四氮唑和4-氯乙酰乙酸乙酯在强碱作用下反应得到式(3)所 示结构的中间体;

②将式(3)所示结构的中间体在强碱作用下和盐酸胍反应得到式(2)所示结构的 中间体;

③将式(2)的中间体和异氰酸酯类或者异硫氰酸酯类化合物反应,生成式(1)所示 结构的目标化合物;其合成的化学反应方程式如下所示:

上述步骤①中,采用的反应溶剂选自甲醇、乙醇或异丙醇任一种或两种;采用的强 碱为氢氧化钾或氢氧化铯中任意一种;反应温度在15℃-75℃之间。

上述步骤②中,强碱选自氢氧化铯、甲醇钠、乙醇钠或LDA中任一种;反应溶剂采用 无水甲醇或无水乙醇,反应温度在50℃-170℃之间。

上述步骤②中,式(3)所示结构的中间体、盐酸胍和强碱的摩尔比为1:(2.05- 2.15):(2.05-2.15)。

上述步骤③中,反应溶剂为非质子溶剂。

本发明的有益效果在于:

本发明合成路线简单,分离过程简便,有利于进行扩大生产。本发明合成的此类小 分子抑制剂有很好的EZH2抑制活性,为恶性肿瘤药物的研发提供了一类新的小分子结构, 这类小分子结构具有多样性,进一步的研究有助于开它的药用价值;

具体实施方式

实施例1

FTCI-2362

取1-苯基-5-巯基–1H-四氮唑1.78g(0.01mol)加入圆底烧瓶,滴加30ml甲醇,搅拌 至白色固体完全溶解。搅拌下滴加4-氯乙酰乙酸乙酯1.81g(0.011mol)室温搅拌反应5h,点 板反应完全。减压旋干甲醇,向残留的油状物中加入5ml去离子水溶解,再加入乙酸乙酯进 行萃取水相三次,合并有机相,干燥,减压回收乙酸乙酯,得到无色油状液体2.82g(93%)。

取上一步得到的油状物1.5g(4.9×10-3mol),加入适量的无水乙醇搅拌搅拌下加 入盐酸胍0.94g(9.8×10-3mol),加入含有0.53g(9.8×10-3mol)甲醇钠的乙醇溶液加热回 流反应8h后,旋干乙醇,水洗后收集有机相旋干。加入15ml去离子水,然后用1mol/L盐酸溶 液调节水溶液PH到9。再向水溶液中加入二氯甲烷进行萃取,收集有机相旋干得粗产物。用 丙酮-正己烷重结晶,最终得到关键中间体白色固体1.13g(77%)。

取中间体0.64g(2.1×10-3mol)溶解于30ml乙腈中,加入2-萘基异氰酸酯,常温反 应5h,点板检测反应完成,生成目标物分子0.93g(96%)1HNMR(501MHz,DMSO)δ10.02(s, 1H),8.06(d,J=8.4Hz,1H),7.97(d,J=8.2Hz,1H),7.92(d,J=7.4Hz,1H),7.77(d,J= 8.2Hz,1H),7.54(ddt,J=24.7,14.9,7.6Hz,9H),6.18(s,1H),4.48(s,2H)。

实施例2

FTCI-2377

取1-苯基-5-巯基–1H-四氮唑1.78g(0.01mol)加入圆底烧瓶,滴加30ml甲醇,搅拌 至白色固体完全溶解。搅拌下滴加4-氯乙酰乙酸乙酯1.81g(0.011mol)室温搅拌反应5h,点 板反应完全。减压旋干甲醇,向残留的油状物中加入5ml去离子水溶解,再加入乙酸乙酯进 行萃取水相三次,合并有机相,干燥,减压回收乙酸乙酯,得到无色油状液体2.82g(93%)。

取上一步得到的油状物1.5g(4.9×10-3mol),加入适量的无水乙醇搅拌搅拌下加 入盐酸胍0.94g(9.8×10-3mol),加入含有0.53g(9.8×10-3mol)甲醇钠的乙醇溶液加热回 流反应8h后,旋干乙醇,水洗后收集有机相旋干。加入15ml去离子水,然后用1mol/L盐酸溶 液调节水溶液PH到9。再向水溶液中加入二氯甲烷进行萃取,收集有机相旋干得粗产物。用 丙酮-正己烷重结晶,最终得到关键中间体白色固体1.13g(77%)。

将0.2g(0.66mmol)中间体溶解于15ml乙腈,加入对氯苯甲酰异硫氰酸酯0.15g (0.792mmol),40℃回流反应8h,有白色固体析出,为目标物分子。1HNMR(501MHz,DMSO)δ 7.97(s,2H),7.60(d,J=67.3Hz,7H),6.78(s,2H),5.62(s,1H),4.25(s,2H),1.22(s,2H)。

实施例3

FTCI-2369

取1-苯基-5-巯基–1H-四氮唑1.78g(0.01mol)加入圆底烧瓶,滴加30ml甲醇,搅拌 至白色固体完全溶解。搅拌下滴加4-氯乙酰乙酸乙酯1.81g(0.011mol)室温搅拌反应5h,点 板反应完全。减压旋干甲醇,向残留的油状物中加入5ml去离子水溶解,再加入乙酸乙酯进 行萃取水相三次,合并有机相,干燥,减压回收乙酸乙酯,得到无色油状液体2.82g(93%)。

取上一步得到的油状物1.5g(4.9×10-3mol),加入适量的无水乙醇搅拌搅拌下加 入盐酸胍0.94g(9.8×10-3mol),加入含有0.53g(9.8×10-3mol)甲醇钠的乙醇溶液加热回 流反应8h后,旋干乙醇,水洗后收集有机相旋干。加入15ml去离子水,然后用1mol/L盐酸溶 液调节水溶液PH到9。再向水溶液中加入二氯甲烷进行萃取,收集有机相旋干得粗产物。用 丙酮-正己烷重结晶,最终得到关键中间体白色固体1.13g(77%)。

苯甲酰氯的无水乙腈溶液(1.4058g,0.01mol)(50毫升)逐滴加入到硫氰酸钾悬浮 液(0.9718克,0.01摩尔)无水乙腈(50毫升)中。将反应混合物在回流下加热45分钟,然后冷 却到室温。过滤,取滤液,得到苯甲酰异硫氰酸酯的乙腈溶液。取30ml上述溶液,向其中加入 0.2g(0.66mmol)中间体,回流反应8h,有浅黄色固体析出,过滤取滤渣,干燥得到目标物分 子固体0.2g(71%)。1HNMR(501MHz,DMSO)δ7.94(s,1H),7.60(d,J=67.3Hz,9H),6.67(s, 2H),5.66(s,1H),4.25(s,2H),1.24(s,2H)。

实施例4

FTCI-2301

取1-苯基-5-巯基–1H-四氮唑1.78g(0.01mol)加入圆底烧瓶,滴加30ml甲醇,搅拌 至白色固体完全溶解。搅拌下滴加4-氯乙酰乙酸乙酯1.81g(0.011mol)室温搅拌反应5h,点 板反应完全。减压旋干甲醇,向残留的油状物中加入5ml去离子水溶解,再加入乙酸乙酯进 行萃取水相三次,合并有机相,干燥,减压回收乙酸乙酯,得到无色油状液体2.82g(93%)。

取上一步得到的油状物1.5g(4.9×10-3mol),加入适量的无水乙醇搅拌搅拌下加 入盐酸胍0.94g(9.8×10-3mol),加入含有0.53g(9.8×10-3mol)甲醇钠的乙醇溶液加热回 流反应8h后,旋干乙醇,水洗后收集有机相旋干。加入15ml去离子水,然后用1mol/L盐酸溶 液调节水溶液PH到9。再向水溶液中加入二氯甲烷进行萃取,收集有机相旋干得粗产物。用 丙酮-正己烷重结晶,最终得到关键中间体白色固体1.13g(77%)。

将0.3g(1×10-3mol)中间体用重蒸THF15ml溶解,搅拌冰浴下滴加TEA0.5ml,冰 浴下滴加含有4-氯甲基苯甲酰氯0.21g(1.1×10-3mol)的THF溶液滴加完毕,室温搅拌反应 3h,点板反应完成,减压旋干THF,加入饱和氯化铵溶液洗涤,再用二氯甲烷萃取水相,合并 有机相干燥旋干柱层析最终得到目标物分子0.2g(55%)。1HNMR(501MHz,DMSO)δ8.10(d,J =8.1Hz,2H),7.67(d,J=6.5Hz,7H),7.13(s,2H),6.68(s,1H),4.89(s,2H),4.58(s,2H)。

应用实施例

采用MTT法进行细胞抑制率检测,测试方法如下:

1.接种细胞:用含10%胎/小牛血清得培养液配成单个细胞悬液,以每孔103-105 个细胞接种到96孔板,每孔体积100-200μL。

2.培养细胞:同一般培养条件,培养1-2天(原代细胞不同,可根据试验目的和要求 决定培养时间,神经元7-10天,心肌细胞8-14天)。

3.吸去原培养基,每孔加入以无血清培养基配制的不同浓度药物(原代细胞例 外)。

4.培养24或48h后,每孔加MTT溶液(5mg/ml,用pH=7.4的PBS配制,避光保存)10- 20μl.(每孔培养基为100μL,加10μl,每孔培养基为200μL,则加20μLl)。

5.37℃继续孵育4h,终止培养,小心吸弃孔内培养上清液(对于悬浮细胞需要离 心后再吸弃孔内培养上清液)。

6.每孔加150ulDMSO,振荡10min,使结晶物充分融解。

7.比色:选择490nm波长,在酶联免疫监测仪上测定各孔光吸收值,记录结果,以时 间为横坐标,吸光值为纵坐标绘制曲线。根据方法获得的细胞抑制率结果如表1所示。

表1细胞抑制率测试结果

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