公开/公告号CN105078949A
专利类型发明专利
公开/公告日2015-11-25
原文格式PDF
申请/专利号CN201410213330.9
申请日2014-05-20
分类号A61K31/155;A61P9/00;A61P9/12;A61P43/00;
代理机构北京三友知识产权代理有限公司;
代理人韩蕾
地址 100191 北京市海淀区花园北路49号
入库时间 2023-12-18 12:16:22
法律状态公告日
法律状态信息
法律状态
2018-11-20
授权
授权
2015-12-30
实质审查的生效 IPC(主分类):A61K31/155 申请日:20140520
实质审查的生效
2015-11-25
公开
公开
技术领域
本发明涉及二甲双胍的新应用,具体是其作为转化生长因子-β受体拮抗剂的新 应用。
背景技术
转化生长因子-β(Transforminggrowthfactorbeta,TGF-β)属于TGF-β超家族蛋 白,是由两个结构相同或相近的、分子量的12.5kDa亚单位借二硫键连接的双体。在 哺乳动物至少发现有TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3、TGF-β1β2四个亚型。TGF-β1与 TGF-β2有71%氨基酸同源性,TGF-β1与TGF-β3有77%同源性,TGF-β2与TGF-β3 有80%同源性。TGF-β与TGF-β超家族其化成员有30~40%同源性。人TGF-β1、 TGF-β2和TGF-β3的基因分别定位于染色体19q3、1q41和14q24,均含有7个外显 子,核苷酸序列有高度同源性,所编码的前体分子C端者有9个保守的Cys,提示 TGF-β1、TGF-β2和TGF-β3基因可能来自一个共同的祖先基因。人和小鼠TGF-β1 的同源性高达99%,表明在不同种属中TGF-β都具有重要的生物学功能。研究表明, TGF-β参与多种细胞功能,包括细胞生长、细胞迁移与侵袭、上皮-间质转化 (Epithelial-mesenchymaltransition,EMT)、细胞外基质(extracellularmatrix,ECM)重 构及免疫调节等功能。TGF-β在肿瘤、纤维化和炎症等疾病状态中高表达,并且这些 高水平的TGF-β加重了疾病进展,因此TGF-β信号通路成为研发相关药物的重要靶 点。
TGFβ1下游经典的激活通路是Smad信号通路。TGFβ1与II型TGF-β受体结合, II型TGF-β受体二聚化增加,招募I型TGF-β受体组成复合物,II型TGF-β受体具有 丝/苏氨酸激酶活性,可磷酸化并激活I型TGF-β受体,继而磷酸化下游的receptor activatedSmads,R-Smads(Smad2,Smad3),磷酸化后的Smad2/3与Co-Smad(Smad4) 结合,转位入核,作为转录因子启动基因表达(PMID:22992590)。
高水平的TGF-β参与肿瘤发生发展的机制主要包括以下两个方面:第一,促进 上皮-间质转化(EMT)。EMT可促进肿瘤细胞迁移(migration)并更具有侵袭性 (invasive)。EMT还促进细胞向肌成纤维细胞(myofibroblast)表型转化。肌成纤 维细胞增加细胞外基质产生,增加间质液体压力,从而使抗肿瘤药物难以达到肿瘤内。 另外,EMT还使肿瘤细胞向“干细胞样”特性转化,增加肿瘤生长能力以及其抗药 性。第二,抑制免疫反应。肿瘤进展过程中,高水平的TGF-β通过减弱CD8+T细胞, CD4+T细胞和树突状细胞的抗肿瘤效应,抑制机体的免疫监督能力。TGF-β还可抑 制自然杀伤细胞产生干扰素γ,而干扰素γ是自然杀伤细胞杀死肿瘤细胞所必须的因 子。TGF-β可促进巨噬细胞由M1型向M2型转化。M1型主要参与攻击外来物如肿 瘤细胞。而M2型的攻击能力明显下降,主要分泌大量炎症因子,如白介素6、白介 素1和TGF-β。这些因子加重局部疾病状态,促进肿瘤进展和炎症(PMID:23000686)。
TGF-β的另一重要生物学功能为促纤维化。纤维化的主要表现为成纤维细胞的堆 积和细胞外基质如胶原的大量分泌。TGF-β是公认的促纤维化的因子,它促进胶原的 合成和成纤维细胞的沉积。同时,TGF-β促EMT的效应还会进一步的加重纤维化, 包括肺脏、心脏、肾脏以及手术后的动脉再狭窄等(PMID:23000686)。因此TGF-β 已作为不同种纤维化疾病的共同治疗靶点。例如特发性肺纤维化(表现为原因不明的 进行性肺功能下降,5年生存率仅20%)、肾纤维化、硬皮病、马凡氏综合征以及眼 角膜术后的角膜纤维化的治疗等(PMID:23063463PMID:23000686)。由于心脏纤维 化是导致心力衰竭的重要病理过程,因此以TGF-β为靶点的抗纤维化治疗也被认为 是预防心力衰竭的重要治疗靶点(PMID:21883991)。只是目前还没有临床实验将 TGF-β信号通路抑制剂应用于心脏纤维化的治疗。
针对TGF-β信号通路的不同成分可有多种药物设计策略,目前已经进入临床实 验的有以下几种:其中大分子抑制剂的有拮抗配体的反义寡核苷酸(antisense oligonucleotides,ASO)和单克隆抗体;小分子抑制剂主要为一些小分子化合物,其作 用靶点是TGF-βI型受体。
反义寡核苷酸(ASO):ASO是一段人工合成的单链核苷酸序列,与靶基因或 mRNA某一区段互补。ASO进入细胞后,通过碱基互补原则结合于靶基因/mRNA上, 通过不同机制影响靶基因的表达。在靶标实验中证明有效的反义寡核苷酸可以被进一 步开发成为反义寡核苷酸药物。目前开发的针对TGF-β信号通路的ASO主要是针对 配体靶基因,如TGF-β1、TGF-β2。针对TGF-β2的ASO,如AntisensePharma公司 开发的Trabedersen(AP12009),用于治疗胶质细胞瘤与胰腺癌,现已进入III期临床 实验。同一公司开发的针对TGF-β1的ASO,用于治疗非小细胞肺癌,目前尚在临床 前阶段(PMID:20001556)。此外,基于反义核苷酸技术,NovaRx公司开发了异体 肿瘤细胞疫苗(Belagenpumatucel-L,Lucanix),该异体疫苗制备自四种肺癌细胞株, 用含TGF-β2的反义基因质粒进行转染,使TGF-β2产生减少,从而帮助机体重建对 肿瘤细胞的免疫力,目前已进入III期临床实验(PMID:16966690)。然而,ASO作 为TGF-β抑制剂的实际应用存在以下问题:①效率低:由于ASO需进入细胞内与靶 基因结合才能发挥作用。但是未经修饰的ASO由于其自身电荷特性使得它很难穿过 细胞膜进入细胞内。即便人们设计了多种方案例如化学修饰、加入载体等以促进ASO 进入细胞,但ASO被细胞摄取的效率仍很低。②不稳定:ASO通常为20nt左右的单 链核苷酸,未经修饰的ASO很容易被生物体液中的核酸酶降解。即便化学修饰可以 增强其抵抗核酸酶的能力,但其稳定性仍远不如化合物。③给药不方便,难以到达靶 器官:作为大分子抑制剂,ASO的药代动力学特性使得它难以到达靶器官发挥治疗 效应。虽然可以局部用药,但对于一些内部器官肿瘤,如神经胶质瘤,局部应用通常 为有创的,副作用严重,患者无法因此受益。④造价高:ASO要真正用于临床,需 要经过各种化学修饰并加上载体,以促进ASO抵抗核酸酶的能力和被细胞摄取的效 率。因此造价相对较高。
单克隆抗体:单克隆抗体技术(monoclonalantibodytechnique)是将产生抗体的单 个B淋巴细胞同肿瘤细胞杂交,获得既能产生抗体又能无限增殖的杂种细胞并以此 生产抗体的技术。单克隆抗体是一种非常有效的抑制TGF-β信号通路的治疗策略。 它可特异性地与配体结合,阻止配体与受体的结合,从而有效地切断下游信号通路。 与ASO不同的是,单克隆抗体在细胞外发挥作用。这一特性一方面使得它比ASO能 更有效地发挥作用,另一方面使得单克隆抗体可以只阻断过多的配体作用,而不会像 ASO那样有可能使TGF-β表达过低,无法发挥其正常生理功能(PMID:23000686)。 目前进入临床实验的针对TGF-β信号通路的单克隆抗体基本都是人源化抗体,例如 CambridgeAntibodyTechnology开发的抗TGF-β1配体的Metelimumab(CAT-152),抗 TGF-β2配体的Lerdelimumab(CAT-192)和针对TGF-β1、TGF-β2、TGF-β3三种配体 的Fresolimumab(GC-1008)。EliLilly公司开发的抗TGF-β1配体的LY2382770。然而, 单克隆抗体的应用存在以下局限性:①组织穿透性差:单克隆抗体给药途径仅限于静 脉给药。然而,单克隆抗体分子量大,难以穿透肿瘤组织,到达靶组织。有研究发现, 在动物模型中,给予抗肿瘤特异性抗原的单克隆抗体治疗,只有不到20%的抗体到达 肿瘤内,其余大多数都在血液中(PMID:17154393)。②不易储存:大多数单克隆抗 体是大分子糖蛋白,分子量大,结构复杂,不利储存。储存条件不当,很容易导致抗 体失活。③造价高:单克隆抗体研发费用高(平均每个单抗药物的研发费用为10~ 18亿美元)、生产过程技术含量和质量标准高、用药量大、培养液及发酵设备昂贵 使得抗体药物价格居高不下。
小分子抑制剂:目前开发的小分子抑制剂主要是在受体水平阻断TGF-β超家族 信号通路。这些小分子抑制剂通常为ATP类似物,可以竞争性地结合在TGF-βI型 受体激酶的ATP结合口袋,抑制TGF-βI型受体的激酶活性,从而抑制下游Smad磷 酸化,发挥其拮抗TGF-β信号通路的作用。这些小分子化合物的优点在于:造价低 廉,可大规模生产;稳定,不易失活;给药方便,可口服。但这些小分子抑制剂也存 在以下缺点:特异性不够高,由于这些小分子抑制剂针对的是受体的激酶活性,有可 能抑制其它激酶的活性,产生非预期的副作用。
另一方面,二甲双胍是一类广泛用于治疗糖尿病的一线口服降糖药,它主要通过 抑制肝脏葡萄糖产生发挥降糖作用。由于二甲双胍并不刺激胰岛素分泌,不会出现低 血糖的副作用,甚至对于高胰岛素血症还具有降低血浆胰岛素的作用,因而它被称作 “胰岛素增敏剂”。二甲双胍是目前唯一被证实具有心血管保护作用的降糖药。此外 它还可以用于治疗一些伴随有胰岛素抵抗的疾病,如多囊卵巢综合征(PMID 14576245)、非酒精性肝病(PMID11567710)。二甲双胍的副作用较少,主要为胃 肠道反应和乳酸酸中毒。乳酸酸中毒多见于药物过量和有禁忌症的患者(如肾功能受 损等)。二甲双胍是一个小分子化合物,临床用药为盐酸二甲双胍,分子量仅165.62。 它在生理pH值条件下为水溶性的正价阳离子,脂溶性很低,因而难以透过细胞膜, 需要转运子转运入胞内。二甲双胍在体内几乎不与任何蛋白结合,不被代谢,以原型 进入尿液排出体外。对于肾功能正常的患者,清除半衰期为5小时(PMID:21241070)。 目前认为二甲双胍药理作用的分子机制主要是通过激活AMP激活激酶(AMP activatedkinase,AMPK)。
另有文献报道二甲双胍可以抑制病理刺激引起的心脏纤维化,其机制为抑制 TGF-β下游Smad3信号通路(PMID:20200042)。但是具体二甲双胍如何抑制TGF-β 信号通路并不清楚。
经检索,未发现现有技术中有将二甲双胍或其盐用作TGF-β拮抗剂的报道。
发明内容
本发明的一个目的在于提供一种新型安全的转化生长因子-β(Transforminggrowth factorbeta,TGF-β)拮抗剂。
本发明的另一目的在于提供二甲双胍(metformin)或其药学上可接受的盐作为 TGF-β受体拮抗剂的新应用。
本发明的另一目的在于提供一种阻止TGF-β配体与受体结合的方法。
本案发明人在研究中发现,二甲双胍或其药学上可接受的盐可作为TGF-β受体 拮抗剂,其能够与TGF-β结合,阻止配体与受体的结合,从而有效地切断下游信号 通路。
具体而言,本发明通过实验证实二甲双胍或其药学上可接受的盐对碘125标记 TGF-β1结合其受体具有抑制作用。进一步,利用单分子荧光成像技术分析二甲双胍 或其药学上可接受的盐对TGF-β1II型受体(TβRII)二聚化比例的影响,明确二甲双胍 或其药学上可接受的盐抑制TGF-β1引起的受体二聚化比例增加。更进一步的研究证 实二甲双胍或其药学上可接受的盐并不影响TGFβ1与其受体的结合力,但抑制 TGFβ1与其受体的结合概率。此外,通过分子对接与分子动态模拟分析了二甲双胍 或其药学上可接受的盐与TGFβ1或其受体之间可能的结合位点。并最终通过蛋白质 印迹法验证了二甲双胍或其药学上可接受的盐通过与TGF-β1而非TβRII结合阻断 TGF-β信号通路。
从而,一方面,本发明提供了一种新型安全的转化生长因子-β(Transforminggrowth factorbeta,TGF-β)受体拮抗剂,其包括有效量的二甲双胍或其药学上可接受的盐。
根据本发明的具体实施方案,二甲双胍或其药学上可接受的盐中,所述药学上可 接受的盐为盐酸盐,即,二甲双胍的药学上可接受的盐为盐酸二甲双胍。
另一方面,本发明提供了二甲双胍或其药学上可接受的盐作为TGF-β受体拮抗 剂的新应用。
另一方面,本发明提供了一种阻止TGF-β配体与受体结合的方法,该方法包括 利用二甲双胍或其药学上可接受的盐,使其与TGF-β配体结合,从而阻止TGF-β配 体与受体结合。
二甲双胍兼具单克隆抗体和小分子抑制剂的优点:它与单克隆抗体一样在细胞外 发挥作用;分子量小,易于进入靶向组织;给药方便,可口服;半衰期短,易于控制 剂量,如出现不良反应可及时停药;稳定,不易失活;造价低廉,可大规模生产。另 外,由于二甲双胍已在临床应用几十年,从安全性的角度来说已有大量证据。因此, 根据本发明的研究成果提示,二甲双胍有望作为新的TGF-β拮抗剂应用于临床。
附图说明
图1:二甲双胍对碘125标记TGF-β1结合其受体的抑制作用。将无二甲双胍组的 特异性结合放射强度设为100%。此为三次独立实验结果。
图2A~图2D:单分子荧光成像技术分析二甲双胍对TGF-β1II型受体(TβRII)二 聚化比例的影响。其中,图2A:细胞膜表面TβRII-GFP的典型单分子图像,圈内的 即为单个分子的TβRII-GFP信号,用于荧光强度分析,再进行荧光漂白得到漂白曲 线,标尺为5μm。图2B:二甲双胍对TGF-β1(5ng/mL)作用下TβRII二聚化比例的 影响。图2C:一步漂白曲线代表图,提示该荧光信号代表单个TβRII-GFP分子即单 体形式。图2D:二步漂白曲线代表图,提示该荧光信号代表两个TβRII-GFP分子即 二聚体形式。
图3:用TGF-β1修饰的AFM针尖在活细胞上进行单分子测力的示意图。
图4A~图4D:原子力显微镜分析TGF-β1与TGF-βII型受体(TβRII)之间结合力 及结合概率。图4A与图4B分别为无二甲双胍(metformin)和1mM二甲双胍下, TGF-β1与TGF-β受体结合力的统计分布。图4C:比较有无二甲双胍情况下,TGF-β1 与TGF-β受体结合力的大小。图4D:比较有无二甲双胍情况下,TGF-β1与TGF-β 受体结合概率的变化。TGF-β1中和抗体可以阻止TGF-β1与其受体结合,此处作为 阳性对照。
图5A为二甲双胍(灰色小分子)在TGF-β1ARG25和His34处的结合视图。图 5B为二甲双胍与TβRII在ILE53和PHE30处形成的结合构象。蛋白质表面以深色代 表TGF-β1和TbRII的结合界面。
图6A与图6B分别为TGF-β1:二甲双胍(metformin)体系与TGF-βII型受体 (TbRII):二甲双胍体系的均方根位移偏差(RMSD)变化图。
图7:二甲双胍(metformin)与TGF-β1相互作用图。虚线代表氢键,实线代表 疏水作用。
图8:蛋白质印迹法验证二甲双胍通过与TGF-β1而非TGF-β受体结合阻断TGF-β 信号通路。
图9:二甲双胍抑制血管紧张素II引起的心脏纤维化实验结果。
具体实施方式
下面结合具体实施例进一步阐明本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明 而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,按照所属领 域的常规操作进行,或按照制造厂商所建议的条件进行。
以下各实施例中,所用原始试剂和材料均可商购获得。各实施例中所用二甲双胍 为其盐酸盐的形式,即,盐酸二甲双胍。
实施例1、碘125标记TGF-β1结合实验
小鼠胚胎成纤维细胞系3T3细胞种于24孔板,当接近长满状态时,加入50pM 碘125标记TGF-β1(PerkinElmer)以及不同浓度的二甲双胍(metformin)。4度孵育4 小时后,冰上用结合缓冲液(50mMHepes,128mMNaCl,5mMKCl,5mMMgSO4, 和1.2mMCaCl2)冲洗5次。再用含1%TritonX-100的结合缓冲液裂解细胞,收集 各孔裂解液,利用γ计数器(上海核所日环光电仪器有限公司)测放射性强度。非特 异结合孔加入10nM非标记TGF-β1(Peprotech)。三次独立实验。
结果参见图1。将无二甲双胍组的特异性结合放射强度设为100%。三次独立实 验测得二甲双胍对碘125标记TGF-β1结合其受体的半数抑制浓度IC50的对数值为 -4.16±0.53。
本实施例的结果表明,二甲双胍能够抑制TGF-β1与其受体结合。
实施例2、单分子荧光成像技术分析TGF-β1II型受体(TβRII)二聚化比例
TGF-β1与II型TGF-β受体结合后,II型TGF-β受体二聚化增加,进而招募I型 TGF-β受体组成复合物,II型TGF-β受体具有丝/苏氨酸激酶活性,可磷酸化并激活I 型TGF-β受体,继而磷酸化下游的Smad通路。II型TGF-β受体的二聚化,是激活 下游Smad通路的始动步骤。本实施例是研究二甲双胍对II型TGF-β受体二聚化的 影响。
本实施例中,在HEK293细胞中转染胞内端连接有单个绿色荧光蛋白(green fluorescenceprotein,GFP)分子的TGF-βII型受体(TβRII-GFP)质粒(编码全长T βRII的DNA片段通过基因重组被连接到pEGFP-N1(Clontech)的HindIII和BamHI 两个酶切位点之间,形成表达质粒TβRII-GFP)。TβRII-GFP质粒在细胞内低水平 表达后,利用全内反射荧光显微镜,对细胞膜下表面进行单分子成像,根据单个GFP 分子呈现一步荧光光漂白、两个GFP分子呈现两步荧光光漂白的光物理特性,对 TβRII-GFP的光漂白步数进行分析统计,得到受体单体和二聚体的比例。从而研究二 甲双胍对TGF-β1与受体结合后受体二聚化情况的影响。
具体操作步骤如下:
1)质粒转染:HEK293细胞在37℃,5%的CO2的培养箱中培养,培养基为添 加有10%的胎牛血清(HyClone)的DMEM(Gibco)。转染试剂是lipofectamine2000 (Invitrogen)。细胞培养在35-mm的玻璃底培养皿(杭州生友生物技术有限公司) 中。转染时质粒用量为0.2ug/ml。为了实现单分子成像,细胞与质粒孵育时间都小于 4h。冲洗完转染试剂后,细胞在无血清、无酚红的培养基中培养并成像。为使蛋白表 达量升高,细胞用无血清的培养基转染,4h后换成有血清的完全培养基,蛋白再次 表达4-12h后才用于荧光成像。若要对细胞添加配体刺激,首先往转染后的细胞中 加入含有200pMTGF-β1(R&D)的无血清培养基中,在4℃条件下刺激15min。转 染或刺激后的细胞用磷酸缓冲液(phosphatebuffersolution,PBS)(4℃)冲洗两次, 然后用4%的多聚甲醛/PBS溶液室温固定30分钟,PBS洗3遍后,室温下成像。
2)单分子荧光成像:单分子荧光成像在物镜型全内反射显微镜上完成,物镜型全 内反射荧光显微镜(TIRFM)搭载于倒置的OlympusIX71显微镜上,配有TIRF照 明器、100X/1.45NA的平场复消色差全内反射物镜(Olympus)和14-bitEMCCD (back-illuminatedelectron-multiplyingcharge-coupleddevicecamera,AndoriXon DU-897BV)。EGFP使用氩离子激光器(MellesGriot)488nm激光激发。采集速度 为10Hz,连续采集300帧。
3)图像分析:细胞单分子荧光强度通过以下步骤得到:每个影像的背景荧光利 用ImageJ(NIH)软件中的“rollingballmethod”去除。每个图像的第一帧用于荧光 点的选择。扣除背景后的影像经滤波过滤再次降低噪音。然后设定一合适的阈值(无 荧光点的区域的平均强度的四倍),低于该阈值被视为背景噪音而丢弃。高于阈值的 候选荧光点中,如果光斑小于3个像素也被视为噪音而丢弃。如果两个荧光点相邻很 近(中心像素间隔小于3像素),两个点都被舍弃。以荧光点的强度最高的像素为中 心的3×3像素区域被作为一个衍射极限内的点,统计这些点的像素强度值并且再次 扣除残余背景而得到强度分布。对于固定细胞,首先对拍摄的300帧图像的每一帧图 像利用ImageJ软件rollingball方法去除荧光背景,然后将前五帧图片叠加后进行平 均。对平均后图片,使用无荧光区域平均强度的四倍设置阈值后,采用高斯拟合的方 法寻找所有高于阈值的点,并对选出的点采用上述提到的标准进行筛选。对于最终符 合标准的单分子点,记录其每一帧的荧光强度值,从而获得其荧光强度随时间的漂白 曲线图,用作漂白步数统计分析。对于部分漂白台阶无法判断或者漂白行为异常的点 给予舍弃(约30%)。漂白步数的分析方法与文献(PMID:18757751)报道的一致。
实验结果如图2A~图2D所示,图2A显示细胞膜表面TβRII-GFP的典型单分子 图像,圈内的即为单个分子的TβRII-GFP信号,用于荧光强度分析,再进行荧光漂 白得到漂白曲线,标尺为5μm。图2B显示二甲双胍对TGF-β1(5ng/mL)作用下TβRII 二聚化比例的影响,根据该图所示结果,二甲双胍可以剂量依赖地抑制TGF-β1引起 的II型TGF-β受体二聚化比例增加。图2C为一步漂白曲线代表图,提示该荧光信号 代表单个TβRII-GFP分子即单体形式。图2D为二步漂白曲线代表图,提示该荧光信 号代表两个TβRII-GFP分子即二聚体形式。
实施例3、原子力显微镜分析TGF-β1与受体之间结合力及结合概率
本实施例利用原子力显微镜(atomicforcemicroscope,简称AFM)分析二甲双胍 对TGF-β1与受体(TbRII)之间结合力及结合概率的影响。实验用的AFM针尖为氮化 硅针尖(型号:NP,针尖半径为20-60nm,Veeco,SantaBarbara,CA,USA),通过 热扰动方法进行校正,弹性常数范围在0.0347到0.0621N/m范围内。针尖的修饰方 法参考文献(PMID:17997544,PMID:19497323):对于针尖的修饰除用乙醇浸泡代替 在氯仿中超声外,清洗方法参照文献(PMID:17997544,PMID:19497323),得到Si-OH 表面。然后将针尖转移至1.0%(v/v)MPTMS的甲苯溶液中,室温反应2h,并依次 用甲苯、丙酮和乙醇清洗,这样就在针尖表面上修饰上了巯基。用氮气吹干后,将硅 片转移到1mg/mlNHS-PEG-MAL(双功能团的PEG作为联结剂)的二甲亚砜(DMSO) 溶液中室温反应3h,然后用DMSO溶液清洗除去未反应的NHS-PEG-MAL,这样通 过AFM针尖上的巯基基团与MAL共价作用将NHS-PEG-MAL连接在了针尖表面。 活化的针尖浸泡在蛋白质TGF-β1的PBS溶液中(3X10-8mol/l),室温培育0.5h,这 样蛋白质通过氨基与PEG的NHS端共价连接。PBS清洗后,将蛋白质修饰好的针尖 在4℃中储存于PBS缓冲溶液中待用。配体TGF-β1修饰的AFM针尖在活细胞上测 力的示意图如图3所示。实验所用仪器为PicoSPMII配有PicoScan3000控制器,及 大扫描头(Agilent,USA)。AFM扫描器安装于倒置荧光显微镜上方(OlympusIX71, Japan)。活细胞上力曲线用PicoScan5软件(Agilent,USA)进行采集,并采用高斯 拟合的方法进行数据统计和分析。所有活细胞上的力曲线均为室温下接触模式所测 得。另外,AFM在活细胞上测得力的大小都是在1.0X104pN/s加载速率下所得。
结果如图4A~图4D所示,图4A与图4B分别为无二甲双胍(metformin)和1mM 二甲双胍下,TGF-β1与TGF-β受体结合力的统计分布;图4C为比较有无二甲双胍 情况下,TGF-β1与TGF-β受体结合力的大小;图4D为比较有无二甲双胍情况下, TGF-β1与TGF-β受体结合概率的变化。TGF-β1中和抗体可以阻止TGF-β1与其受体 结合,此处作为阳性对照。可见二甲双胍并不影响TGF-β1与其受体的结合力(对照 vs.二甲双胍,49.5±1.3vs.49.3±1.4pN),但抑制TGF-β1与其受体的结合概率(对照 vs.二甲双胍,21.7±3.5%vs.9.9±1.2%,P<0.05)。
实施例4、分子对接与分子动态模拟分析二甲双胍与TGF-β1或其受体(TβRII)之 间可能的结合位点
由于二甲双胍可抑制TGF-β1与其受体的结合概率,从理论上来存在三种可能: 通过与TGF-β结合以抑制TGF-β与TβRII的相互作用;通过结合TβRII以抑制TGF-β 与TβRII的相互作用;二甲双胍可以同时与TGF-β和TβRII结合以抑制TGF-β与TβRII 的相互作用。本实施例采用分子对接手段研究TGF-β和TβRII上二甲双胍可能的结 合位点,综合比较了结合自由能、结合位点与TGF-β:TβRII复合体结合界面的远近 程度、二甲双胍结合的稳定性等指标,认为有较大的可能是二甲双胍通过与TGF-β 结合以抑制TGF-β与TβRII的相互作用,进而抑制TGF-β信号通路的靶标,其结合 位点位于在TGF-β参与结合TβRII的关键氨基酸Arg25所形成的口袋。
刚性对接:在最初的对接中,把配体与受体均视为刚性,对整个蛋白的周围空间 进行全局搜索,并对二甲双胍与受体蛋白的复合体构象作聚类分析(同一个聚类中配 体位置的均方根偏差RMSD<0.2nm),从而挑选出二甲双胍可能的一些结合位点。 在这些结合位点中优先选择二甲双胍在TGF-β1:TbRII的结合位点附近且配体与受体 的几何匹配程度好的结合构象。图5A为二甲双胍(深色小分子)在TGF-β1ARG25 和His34处的结合视图,图5B显示二甲双胍与TβRII在ILE53和PHE30处形成的 结合构象。蛋白质表面以深色代表TGF-β1和TbRII的结合界面。其对应的结合数据 由表1可得。以TGF-β1蛋白为例,在一百次对接中二甲双胍有12次结合在TGF-β1 与TβRII的结合界面,其中最低的结合自由能为-17.66kJ/mol,排名第6。而在TβRII 蛋白中,在一百次对接中二甲双胍有2次结合在TGF-β1与TbRII的结合界面,其中 最低的结合自由能为-17.37kJ/mol,排名第4。
表1二甲双胍刚性对接数据(在TGF-β1-TbRII结合位点附近)
柔性对接:在上述的基础上,将搜索区域限制在刚性对接中挑选出的结合位点(即 排名第6/4的两个复合体结构中二甲双胍的结合位点)附近4.5A的区域,并考虑了 配体的柔性作了进一步的精细的对接,而受体仍为刚性。从表2比较可以明显看到, 在考虑了配体柔性后,受体蛋白与二甲双胍的结合稳定性进一步上升,尤其在TGF 系统中更为明显。本发明进一步对这两个复合体进行分子动力学的优化。
表2二甲双胍柔性对接数据
分子动力学模拟:在动力学模拟的过程,将通过二甲双胍位置的均方根位移偏差 (RMSD)来反映药物与蛋白的结合稳定性(药物相对于蛋白的运动)及蛋白质和配体自 身构象的变化,并在此基础上进一步分析药物与蛋白间形成相互作用力。
TGF-β1:二甲双胍(metformin)体系与TbRII:二甲双胍体系的RMSD变化图参见 图6A与图6B。由图6A可以明显看出在TGF-β1:二甲双胍体系中,二甲双胍相对于 TGF-β1的RMSD很小,与TGF-β1或二甲双胍分子本身的结构RMSD接近。这提示 二甲双胍可以较稳定的与蛋白结合在一起,这很大程度上是由于配体与结合位点的形 状匹配程度较好。而由图6B可看出在TbRII:二甲双胍体系中,二甲双胍相对于 TGF-β1的RMSD明显大于TbRII或二甲双胍分子本身的结构RMSD。这提示二甲双 胍与TbRII的结合很不稳定。再请参见图7所示二甲双胍(metformin)与TGF-β1相 互作用,虚线代表氢键,实线代表疏水作用,二甲双胍的两个甲基主要与结合口袋底 部的PHE24、ILE33的疏水侧链发生相互作用,而极性的N原子可以与ARG25侧链 的NE-HE和NH2-HH21形成氢键。
MM/PBSA计算结合自由能
ΔGbind=ΔGvacum+ΔGsol
其中:ΔGvacum=ΔEMM–TΔS
ΔEMM=ΔEinte+ΔEcoul+ΔEvdw
ΔGsol=ΔGPB+ΔGSAS
ΔGSAS=λΔSAS+βλ=2.2kJ/(mol.nm2)β=3.84kJ/mol
结合过程中自由能的变化分为配体和受体直接的相互作用能(ΔEMM),包含分 子内能(即分子自身的相互作用能ΔEinte),库伦相互作用(ΔEcoul),范德华(ΔEvdw); 结合过程中熵的变化(–TΔS),这两项并不需要考虑溶剂效应,可归纳为ΔGvacum。 而结合过程中的溶剂效应包含非极性溶剂化自由能(ΔGSAS),正比于溶剂可及面积 的差值(即:ΔSAS);以及极性部分的溶剂化自由能(ΔGPB)。
在计算过程中,分子内能的变化为零,ΔEinte=0。ΔEcoul=-90.76kJ/mol;ΔEvdw=-61.66kJ/mol;ΔSAS=-2.92nm2;ΔGSAS=-2.58kJ/mol;-TΔS=-63.67。
溶剂化能中的极性项由APBS1.4软件计算:ΔGPB=22.83kJ/mol
最后得到结合自由能为ΔGbind=-68.50kJ/mol。
结论:本实施例通过分子对接和分子动力学模拟手段探讨了TGF-β和TβRII上 二甲双胍可能的结合位点。认为有较大的可能是二甲双胍通过结合TGF-β1抑制 TGF-β信号通路,其结合位点位于在TGF-β参与结合TβRII的关键氨基酸Arg25附 近。具体相互作用方式包括二甲双胍的两个甲基主要与结合口袋底部的PHE24、ILE33 的侧链发生相互疏水作用,和极性的N原子与ARG25侧链的NE-HE和NH2-HH21 形成氢键作用。本实施例同时采用MM/PBSA法估算二甲双胍与TGF-β1蛋白的结合 自由能约为-68.50kJ/mol。
实施例5、蛋白质印迹法验证二甲双胍通过与TGF-β1而非TβRII结合阻断TGF-β 下游Smad信号通路
小鼠胚胎成纤维细胞系3T3细胞种于6孔板,分为两组。一组细胞给予不同浓度 的二甲双胍预处理2小时后再给予TGF-β15ng/mL刺激细胞30分钟。另一组细胞的 处理则是:将不同浓度的二甲双胍与TGF-β1在试管中预混于细胞培养液中,然后放 入细胞培养箱2小时,再将混合培养液加入另一组细胞中刺激30分钟。收样时,冷 PBS洗细胞二次,加入80μl细胞裂解液(20mmol/LTris-HClPH7.4,150mmol/L NaCl,2.5mmol/LEDTA,50mmol/LNaF,0.1mmol/LNa4P2O7,1mmol/LNa3VO4,1% TritonX-100,10%glycerol,0.1%SDS,1%deoxycholicacid,1mmol/LPMSF,and1 mg/mlaprotinin)裂解细胞10分钟,用细胞刮刮下并移入Ep管中,超声处理后于4 ℃,12,000g离心15min。收上清,蛋白定量后加入5×SDS凝胶加样缓冲液,100 ℃煮沸5min后冻存。将细胞裂解液进行蛋白质印迹法实验检测TGF-β信号通路下游 磷酸化Smad3,具体步骤包括:10%SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳90V2小时,硝酸纤 维素膜转膜200mA2小时;电泳转移结束后,将膜放入5%牛奶(inTBST)室温封 闭1小时;一抗(磷酸化Smad31:1000in5%BSATBST,cellsignaling)4度孵育过 夜;TBST洗膜后,二抗(1:2000in5%牛奶TBST)室温1小时,TBST洗膜后显影; 将膜置于2mL反应液(1mLA液,1mLB液,MilliporeCorporation)室温孵育2min, 缓慢轻摇,将膜上液滴滴尽后封入保鲜膜,压入X光片曝光(曝光时间视信号强弱 而定)。
结果如图8所示,第一组处理方式,二甲双胍需至少100μM才可明显抑制TGF-β1 引起的磷酸化Smad3增加;第二组处理方式,二甲双胍仅1pM便可显著抑制TGF-β1 引起的磷酸化Smad3增加。第一组处理方式是让二甲双胍与细胞上的TβRII充分接 触,第二组处理方式是让二甲双胍与TGF-β1在体外充分接触。结果提示二甲双胍通 过与TGF-β1而非TβRII结合阻断TGF-β信号通路。
综上所述,二甲双胍可作为TGF-β受体拮抗剂,与TGF-β结合,阻止TGF-β1 与其受体的结合,从而有效地切断下游信号通路。
实施例6、二甲双胍减轻高血压疾病模型小鼠的心脏纤维化实验
10周龄雄性C57BL6小鼠,采用血管紧张素II(3mg/kg*dayX7天)皮下埋泵方法 制备高血压疾病模型。埋泵前3天开始每天皮下注射盐酸二甲双胍(200mg/kg体重) 至埋泵后1周。采用组织切片的方法评价心脏纤维化情况。结果如图9所示,与对照组 相比,血管紧张素II明显促进心脏纤维化(纤维化面积百分比:1.99±0.846vs.12.60± 1.97%,P<0.05),盐酸二甲双胍对心脏纤维化无明显影响(纤维化面积百分比:1.99 ±0.846vs.2.31±0.51%),二甲双胍抑制血管紧张素II引起的心脏纤维化(纤维化面 积百分比:12.60±1.97%vs.7.26±1.30%,P<0.05),因此应用二甲双胍可以减轻高 血压疾病模型小鼠的心脏纤维化。
在其它与TGF-β相关的疾病模型中,也可应用二甲双胍治疗抑制TGF-β的作用。
机译: 治疗骨髓纤维化的方法包括施用转化生长因子β型II型受体拮抗剂
机译: 转化生长因子β1受体拮抗剂的筛选方法
机译: 纯5-HT受体拮抗剂的新应用