猪细小病毒样颗粒B细胞表位插入位点的分子设计

摘要

本发明涉及猪细小病毒样颗粒B细胞表位插入位点的分子设计，属于基因工程疫苗领域。使用生物信息学软件对猪细小病毒(PPV)衣壳蛋白VP2结构建模，经三维结构分析确定VP24个突出的Loop结构所在区；首先在分子模拟和文献支持的基础上，我们推测loop 2，4区可作为外源表位基因插入位点。试验证明，分别缺失PPV VP2 Loop2(212aa～245aa)，Loop4(413aa-424aa)内的相应基因，再用腺病毒表达系统表达，结果Loop2，4缺失突变重组病毒均能装配出规则的病毒样颗粒[PPV：ΔVLPs]。本发明还涉及该重组病毒表达外源基因的重组PPVΔVP2病毒样颗粒在疫苗免疫等方面的应用。

说明书

一、技术领域

本发明涉及猪细小病毒样颗粒B细胞表位插入位点的分子设计，属于基因工程疫苗领 域。

二、背景技术

猪细小病毒(PPV)病毒粒子外观呈六角形或圆形，无囊膜，二十面体等轴立体对称， 衣壳由32个壳粒组成，PPV基因组编码2条结构多肽，VPl和VP2。分子质量分别为84 ku和64ku，另有一条结构多肽VP3由VP2水解而产生，分子质量60ku。其中VP2是 构成病毒粒子的主要衣壳蛋白，该蛋白上包含了PPV的主要保护性抗原。VPl蛋白C端 氨基酸与VP2的N端氨基酸序列相互重叠。VP2的C端暴露在该蛋白的表面，因此C段 的完整性是保持该衣壳蛋白二级结构所必需的，而其N端位于二级结构的内部。

病毒样颗粒(VLPs)作为疫苗递送工具，有两个突出的特色和优势：第一，以化学 交联或基因工程的方法可对其表面进一步修饰改造；第二，VLPs可包裹分子量及电荷适 宜的核酸或非核酸分子。这两个特点为按照不同目的灵活多样地设计、优化疫苗提供了理 想的平台。概而言之，不同疫苗形式如多肽、核酸、甚至佐剂都可以单独或组合地在VLPs 上挂载或负载，从而克服其各自不足。多肽-VLPs嵌合疫苗：多肽抗原易于制备，但免疫 原性弱，进入机体后易于降解，这限制了多肽疫苗的实际应用。如果将多肽整合入VLPs 内，则可能克服这些障碍。

VP2基因在哺乳动物细胞内或杆状病毒表达时能自主装配成病毒样颗粒并具有良好 的免疫原性。Sedlik等将PPV VP2 N末端和包含淋巴细胞脉络丛脑炎病毒(LCMV)的 118-132位氨基酸的抗原决定簇区相连，然后克隆于杆状病毒表达载体PACYM，转染表 达VP2-LCMV蛋白，利用该重组蛋白免疫鼠可以诱导强烈的细胞毒性T细胞反应(CTL反 应)，在体内持续时间长达9个月，并可抵抗致死量的LCMV攻击。Richard等用PPV VP2 共价结合乙肝病毒HBSAg决定簇区多肽，然后免疫小鼠诱导产生很强的针对插入的 HBSAg决定簇的T细胞反应，并能抵抗乙肝病毒致死性攻击。现有研究表明：可以利用 VP2自我包装成空壳粒子的特性，将外源基因片段插入到N末端，表达外源基因，作为 一种抗原载体使用，但其携带的外源基因只能刺激T淋巴细胞诱导细胞免疫。

VLPs暴露的重复结构域能够诱导强烈的抗体应答，这使得这些结构域非常适合引入 外源抗原形成VLPs，但插入位点，抗原表位大小常会干扰正确的VLPs形成。Alicia Hurtado 等分别缺失犬细小病毒(CPV)VP2 loop 1，2，3，4内的相应基因，再用杆状病毒表达 系统表达，结果loop 1，3，4的缺失突变株均不能表达出病毒样颗粒，而loop 2(217～234) 的缺失突变株则能装配出规则的病毒样颗粒。他们进一步研究证明loop 2能容纳外源抗原 决定簇。Rueda曾将脊髓灰质炎病毒C3B细胞抗原决定簇的基因分别插入CPV VP2基因 的4个环内和C末端后进行融合表达，结果只有插入环2第225位氨基酸的融合蛋白能产 生抗多肽反应，但不能产生抗骨髓灰质炎病毒中和反应。于是改在环2第226、227、228 位氨基酸处插入，结果这些融合蛋白能产生抗骨髓灰质炎病毒中和反应。

有研究表明，PPV病毒样颗粒表面的三重轴方向有棘状突起(spike)，它是由loop形成 的高级结构，位于衣壳的最表面，包含了PPV的大部分抗原表位；五重轴方向有圆柱形 通道(cylindrical structure)，由5个β-ribbon形成，N末端的部分氨基酸残基在里面折叠并 使中和抗原表面化；此外，五重轴周围有峡谷区(canyon)，二重轴方向有凹陷(depression)， 它们可能是PPV的病毒受体。据此分析认为：VP2的N端作为插入位点虽然能够形成病 毒样颗粒，但是空颗粒的N端处于五重轴的圆柱形通道内，重组体不能刺激产生B细胞 抗原表位的免疫应答；构成五重轴周围的峡谷区和二重轴方向凹陷的肽段同样不适合作为 插入位点。

三、发明内容

技术问题

本发明目的在于猪细小病毒样颗粒B细胞表位插入位点的分子设计及以该重组PPV ΔVP2病毒样颗粒作为B细胞表位载体进行多价重组疫苗的研制。

技术方案

猪细小病毒样颗粒B细胞表位插入位点的分子设计，其特征在于，

1)ΔVP2(Loop 2，4缺失)目的基因的克隆

根据GenBank中NADL-2(NC：001718)基因序列为模板，用软件PrimerPremier 5.0设 计引物Loop 11，Loop 22，Loop 23，Loop 14，Loop 42和Loop 43，其中Loop 11和 Loop 14分别加入酶切位点，引物序列如下：

Loop 11：5-gtc-gac-atg-agt-gaa-aat-gtg-gaa-caa-c-3(sal I)

Loop 22：5-tgg-att-tag-gtt-tct-gat-g-3

Loop 23：5-cat-cag-aaa-cct-aaa-tcc-aga-ctc-aat-aca-aac-agg-act-3

Loop 14：5-gcc-ctc-gag-cta-gta-taa-ttt-tct-tgg-3(xhoI)

Loop 42：5-ttg-ttg-ctt-tgg-agc-tct-tcc-3

Loop 43：5-gga-aga-gct-cca-aag-caa-caa-ctt-tta-cct-tca-gat-cc-3

通过SOE法基因拼接：以质粒pT VP2为模板，以引物Loop 11，Loop 22进行PCR 扩增VP2片段660bp，产物在1％琼脂糖凝胶上电泳后回收；以引物Loop 23，Loop 14 进行PCR扩增VP2片段1047bp，产物在1％琼脂糖凝胶上电泳后回收；再以上述2个 回收产物为模板，引物Loop 11，Loop 14PCR扩增VP2Loop 2缺失片段。分别以引物 Loop11，Loop 42和引物Loop 43，Loop 14扩增VP2片段1227bp和465bp，并分别 回收作模板，再以引物Loop 11，Loop 14 PCR扩增VP2Loop 4缺失片段。将VP2 Loop 2缺失片段和VP2 Loop 4缺失片段分别与pMD19-T Vector连接，转化E.coli DH5α，碱 裂解法提取质粒，分别用sal I和xho I双酶切鉴定，获得阳性质粒pTΔVP2-2和pT ΔVP2-4，并经大连宝生物技术有限公司测序。

2)重组质粒pShuttle-ΔVP2-2，pShuttle-ΔVP2-4的构建与鉴定

利用双酶切位点sal I和xho I将pTΔVP2-2和pTΔVP2-4克隆至转移载体 pShuttle-CMV中；用PCR、sal I和xho I双酶切及测序分析进行鉴定，分别命名为 pShuttle-ΔVP2-2和pShuttle-ΔVP2-4。

3)重组PPVΔVP2-2，PPVΔVP2-4病毒样颗粒的获得

用Pme I酶切该重组质粒，使其线性化，然后与骨架载体pAdEasy^TMVector在1.8kV、 25μF和200Ω条件下电转化至大肠杆菌BJ5183感受态细胞，使pShuttle-ΔVP2-2和 pShuttle-ΔVP2-4与pAdEasyTM Vector发生同源重组，转化至DH5α宿主菌，挑选出阳性 克隆，用PCR、PacI酶切鉴定重组是否正确，构建成重组质粒，分别命名为pAd-ΔVP2-2 和pAd-ΔVP2-4。

4)将重组质粒pAd-ΔVP2-2和pAd-ΔVP2-4转染HEK-293A细胞，获得重组病毒 rAd-ΔVP2-2和rAd-ΔVP2-4；重组腺病毒表达蛋白在HEK-293A细胞中自我装配成病毒 样颗粒PPV：ΔVLPs，即为获得的Loop 2，4基因缺失的重组PPVVP2病毒样颗粒。

上述猪细小病毒样颗粒B细胞表位插入位点的分子设计及以该重组PPVΔVP2病毒样 颗粒在制备疫苗方面的应用可以获得猪细小病毒样颗粒载体多价重组疫苗。

有益效果本发明的特点和优点如下：

1、本发明应用的腺病毒表达系统是缺失了E1和E3基因的人腺病毒血清5型(Ad5)， 具有无致病性、复制效率高、克隆空间大(可容纳7.5Kb的外源片段)、能在大多数哺乳动 物细胞和组织中表达重组蛋白、在同种细胞和组织中可同时表达多个基因等特点，可对外 源基因进行正确的翻译和修饰，使表达的蛋白具有与天然蛋白相同的生物活性。使用该系 统构建的重组病毒用于猪体，还可以避免由于猪体自身产生的腺病毒抗体影响免疫效果。

2、使用生物信息学软件sybyl软件进行了vp2蛋白的结构建模，同时使用Discovery  Studio软件与NAMD软件在“刀片机”上进行进行分子动力学计算，得出了正确的vp2 蛋白三维结构，分析其三维结构，确定VP24个突出的Loop结构所在区：Loop 1： 86aa-101aa；Loop 2：212aa-245aa；Loop 3：279aa-333aa；Loop 4：413aa-424aa。在分子模 拟和文献支持的基础上，我们推测loop 2，4区可作为外源表位基因插入位点。

3、Sadeyen等[2003]将HBV核心抗原的一个免疫显性表位多肽DPASRE分别插入 HPV16 L1-VLPs外表面的6个环区，这6种嵌合VLPs均能诱导出HBc特异性抗体，但 在BC环区插入外源肽后，机体产生的抗HPV16 L1的中和性抗体滴度则明显下降。提示 BC环区是形成HPV16 L1构象表位的关键位置，在此处插入常会干扰正确的VLPs形成。 本发明分别缺失PPV VP2 loop 2，4内的相应基因，再用腺病毒表达系统表达，结果loop 2， 4的缺失突变株均能表达出病毒样颗粒，初步验证loop 2(212aa-245aa)，Loop 4： (413aa-424aa)能容纳外源抗原决定簇。

4、病毒样颗粒(VLPs)作为疫苗递送工具，有两个突出的特色和优势：第一，以化 学交联或基因工程的方法可对其表面进一步修饰改造；第二，VLPs可包裹分子量及电荷 适宜的核酸或非核酸分子。这两个特点为按照不同目的灵活多样地设计、优化疫苗提供了 理想的平台。概而言之，不同疫苗形式如多肽、核酸、甚至佐剂都可以单独或组合地在 VLPs上挂载或负载，从而克服其各自不足。Saini[2003]将日本脑炎病毒(JEV)E蛋白的一 个表位多肽，通过一个柔性连接子(Gly4-Ser)3与Johnson草花斑病毒(JGMV)的C端缺失 衣壳蛋白连接后，形成一种嵌合VLPs；这种嵌合VLPs不需佐剂免疫小鼠后，产生的中 和抗体，可有效地保护小鼠免于致死性日本脑炎病毒攻击。本发明构建重组PPVΔVP2 病毒样颗粒作为B细胞表位载体进行多价重组疫苗的研制，不但安全性高、价廉，而且制 备多种病原体和/或多个亚型病原体的嵌合PPV VLps疫苗。

四、附图说明

图1：PPV VP2目的基因扩增

图2：VP2蛋白三维结构分析

图3：ΔVP2(Loop 2，4缺失)目的基因扩增ΔVP2-2(a)，ΔVP2-4(b)

图4：重组质粒pShuttle-ΔVP2-2(a)，pShuttle-ΔVP2-4(b)sal I/xhoI双酶切酶切 鉴定

图5：重组质粒pAd-ΔVP2-2(a)和pAd-ΔVP2-4(b)PacI酶切鉴定图谱

图6：重组腺病毒rAd-ΔVP2-2和rAd-ΔVP2-4间接免疫荧光图：rAd-ΔVP2-2(a)， rAd-ΔVP2-4(b)，和细胞对照(c)

图7：免疫转印鉴定

图8：PPVΔVP2病毒样颗粒电镜图rAd-ΔVP2-2(a)，rAd-ΔVP2-4(b)

五、具体实施方式

1)PPVVP2基因的克隆

根据GenBank中NADL-2(NC：001718)基因序列为模板，用软件PrimerPremier 5.0设 计引物P1和P2，分别加入酶切位点，引物序列如下：

P1  5-acc-gga-tcc-atg-ggg-ggg-gtt-ggt-gtg-tct-ac-3(BamH I)

P2  5-atc-ctc-gag-cta-gta-taa-ttt-tct-tgg-3(xho I)

以PPVNADL-2弱毒株(见参考文献：潘群兴，等，检测PCV2、PPV、PRV疫苗 株与野毒株的多重PCR方法，中国病毒学，2005，20(6)603～606；购自中国兽药监察 所；平台资源号：1511C0006H00000087，国家兽医微生物菌种保存中心菌株保藏编号： HVRIPPV0003)为模板，以引物P1和P2进行PCR扩增，产物在1％琼脂糖凝胶上电泳 后，回收并将其与pMD19-T Vector(宝生物工程(大连)有限公司)连接，转化E.coli DH5α(宝 生物工程(大连)有限公司)，碱裂解法提取质粒，分别用BamH I和xhoI双酶切鉴定，获得阳 性质粒pT VP2，并经大连宝生物技术有限公司测序。

2)vp2蛋白的结构建模及分析

在通过数据库多序列比较确认后，我们使用生物信息学软件sybyl软件进行了vp2蛋 白的结构建模，同时使用Discovery Studio软件与NAMD软件在“刀片机”上进行进行分 子动力学计算，得出了正确的vp2蛋白三维结构，分析其三维结构，确定VP24个突出的 Loop结构所在区(Loop 1：86aa-101aa；Loop2：212aa-245aa；Loop3：279aa-333aa；Loop 4：413aa-424aa)。

3)ΔVP2(Loop 2，4缺失)目的基因的克隆

根据GenBank中NADL-2(NC：001718)基因序列为模板，用软件PrimerPremier 5.0设 计引物Loop 11，Loop 22，Loop 23，Loop 14，Loop 42和Loop 43，其中Loop 11和 Loop 14分别加入酶切位点，引物序列如下：

Loop 11：5-gtc-gac-atg-agt-gaa-aat-gtg-gaa-caa-c-3(sal I)

Loop 22：5-tgg-att-tag-gtt-tct-gat-g-3

Loop 23：5-cat-cag-aaa-cct-aaa-tcc-aga-ctc-aat-aca-aac-agg-act-3

Loop 14：5-gcc-ctc-gag-cta-gta-taa-ttt-tct-tgg-3(xhoI)

Loop 42：5-ttg-ttg-ctt-tgg-agc-tct-tcc-3

Loop 43：5-gga-aga-gct-cca-aag-caa-caa-ctt-tta-cct-tca-gat-cc-3

通过SOE法基因拼接：以质粒pT VP2为模板，以引物Loop 11，Loop 22进行PCR 扩增VP2片段660bp，产物在1％琼脂糖凝胶上电泳后回收；以引物Loop 23，Loop 14 进行PCR扩增VP2片段1047bp，产物在1％琼脂糖凝胶上电泳后回收；再以上述2个 回收产物为模板，引物Loop 11，Loop 14 PCR扩增VP2 Loop 2缺失片段。分别以引物 Loop 11，Loop 42和引物Loop 43，Loop 14扩增VP2片段1227bp和465bp，并分别 回收作模板，再以引物Loop 11，Loop 14 PCR扩增VP2 Loop 4缺失片段。将VP2 Loop 2缺失片段和VP2 Loop 4缺失片段分别与pMD19-T((宝生物工程(大连)有限公司)Vector 连接，转化E.coli DH5α，碱裂解法提取质粒，分别用sal I和xhoI双酶切鉴定，获得阳 性质粒pTΔVP2-2和pTΔVP2-4，并经大连宝生物技术有限公司测序。

4)重组质粒pShuttle-ΔVP2-2，pShuttle-ΔVP2-4的构建与鉴定

利用双酶切位点sal I和xho I将pTΔVP2-2和pTΔVP2-4克隆至转移载体 pShuttle-CMV(见参考文献：Construction and immunogenicity of recombinant adenovirus  expressing the capsid protein of porcine circovirus 2(PCV2)in mice.Vaccine. 2006，12；24(16)：337～480)中；用PCR、sal I和xho I双酶切及测序分析进行鉴定，分别 命名为pShuttle-ΔVP2-2和pShuttle-ΔVP2-4。

5)重组PPVΔVP2-2，PPVΔVP2-4病毒样颗粒的获得

用Pme I酶切该重组质粒，使其线性化，然后与骨架载体pAdEasy ^TMVector(见参考 文献：Construction and immunogenicity of recombinant adenovirus expressing the capsid  protein of porcine circovirus 2(PCV2)in mice.Vaccine.2006，12；24(16)：337～480)在1.8kV、 25μF和200Ω条件下电转化至大肠杆菌BJ5183(见参考文献：Construction and  immunogenicity of recombinant adenovirus expressing the capsid protein of porcine circovirus 2 (PCV2)in mice.Vaccine.2006，12；24(16)：337～480)感受态细胞，使pShuttle-ΔVP2-2和 pShuttle-ΔVP2-4与pAdEasyTM Vector发生同源重组，转化至DH₅α宿主菌，挑选出阳性 克隆，用PCR、PacI酶切鉴定重组是否正确，构建成重组质粒，分别命名为pAd-ΔVP2-2 和pAd-ΔVP2-4。

3)重组病毒的获得与纯化

按照脂质体转染试剂操作方法，将预先用PacI线性化的重组质粒pAd-ΔVP2-2和 pAd-ΔVP2-4转染HEK-293A细胞(见参考文献：Construction and immunogenicity of  recombinant adenovirus expressing the capsid protein of porcine circovirus 2(PCV2)in mice. Vaccine.2006，12；24(16)：337～480)，5％CO₂，37℃静置培养10d以上，显微镜观察细胞病 变，当细胞病变达70％时，收毒。经3次噬斑纯化实验，获得重组病毒rAd-ΔVP2-2和 rAd-ΔVP2-4的滴度分别为10^11.8TCID₅₀/mL和10^11.5TCID₅₀/mL。

4)PPVΔVP2病毒样颗粒生物学特征研究

①间接免疫荧光

将重组腺病毒稀释后接种于长满单层的HEK-293A细胞，5％CO2、37℃培养，约24h， 弃去上清，用PBS洗涤一次，37℃干燥45min，-20℃冷冻45min，再以冷的无水乙醇4℃ 固定45min，PBST洗涤3次；分别加入50μL 1∶40稀释的猪抗PPV的血清(b)，37℃作用 1h，用PBST洗涤3次；加入1∶100FITC-SPA，37℃作用1h，洗涤3次；显微镜观察。 重组腺病毒(rAd-ΔVP2-2a)和rAd-ΔVP2-4(b)呈现较强的荧光，而细胞对照孔(c)没有荧 光出现(图6)。说明重组腺病毒在细胞中表达了PPV：ΔVP2蛋白。

②蛋白质印记

用8％PEG-6000浓缩重组腺病毒HEK-293A细胞培养物，同时设定正常HEK-293A 细胞培养物为对照。将上述浓缩蛋白进行SDS-PAGE电泳，转印到硝纤膜后，10％脱脂乳 封闭过夜；加入1∶40猪抗PPV的血清室温作用2h；洗涤3次，加入1∶20000稀释的辣根 过氧化物酶标记的羊抗猪IgG，室温作用1.5h；洗涤4次，加入化学发光法显色液(DAB)， 观察特异蛋白条带。浓缩的重组腺病毒经电泳转印显色后显示，在66KD处均有一条明 显的条带，而对照正常的HEK-293A细胞没有(图7)，说明重组腺病毒在细胞中表达了 ΔVP2蛋白。

③嵌合病毒样粒子的粗纯化与电镜观察

收集病变细胞，用PBS洗两次，1000r/min离心15min，重悬于50mmol/l NaHCO3 中，超声波裂解后，24000r/min离心15min，上清液中含有表达蛋白。腺病毒野毒做同样 处理后做对照。加入1∶10稀释的猪抗PPV血清37℃作用1h后再4℃过夜，以12000 r/min离心90min，沉淀重悬于少量水中，用3％的磷钨酸负染后经透射电镜观察。在电镜 下可以看到大量病毒样粒子存在，呈圆型，直径为30～40nm左右比全病毒粒子稍大，其 形态均与全病毒粒子相似(图8)，说明重组腺病毒rAd-ΔVP2-2和rAd-ΔVP2-4在细胞 中表达的ΔVP2蛋白能自我组装成病毒样颗粒。

④红细胞凝集试验

参照《动物病毒学》，使用0.7％豚鼠红细胞的生理盐水悬液。重组腺病毒rAd-ΔVP2-2 和rAd-ΔVP2-4血凝效价均为1∶64，空的腺病毒野毒没有血凝活性，说明重组腺病毒表达 ΔVP2蛋白保持PPV原有的生物学活性。

5、PPVVLps插入位点分析

病毒样颗粒(VLPs)作为疫苗递送工具，两个突出的特色和优势：第一，以化学交 联或基因工程的方法可对其表面进一步修饰改造；第二，VLPs可包裹分子量及电荷适宜 的核酸或非核酸分子。这两个特点为按照不同目的灵活多样地设计、优化疫苗提供了理想 的平台。概而言之，不同疫苗形式如多肽、核酸、甚至佐剂都可以单独或组合地在VLPs 上挂载或负载，从而克服其各自不足：Saini[2003]将日本脑炎病毒(JEV)E蛋白的一个表位 多肽，通过一个柔性连接子(Gly4-Ser)3与Johnson草花斑病毒(JGMV)的C端缺失衣壳蛋 白连接后，形成一种嵌合VLPs；这种嵌合VLPs不需佐剂免疫小鼠后，产生的中和抗体， 可有效地保护小鼠免于致死性日本脑炎病毒攻击。Vietheer[2007]将丙型肝炎病毒囊膜蛋 白E2高变区(HVR1)插入HBsAg-S主要抗原位点(a决定簇)形成的高免疫性嵌合VLPs， 仍可保持插入HVR1序列的抗原性。Kanda[2008]将人乳头瘤病毒(HPV)HPV16 L1和L2 型共同表位嵌合VLPs，成功地将L2肽呈递于VLPs表面，免疫家兔诱导了足以发挥保护 作用的L1和L2中和抗体。

为寻找PPV VLps有效组装的外源B细胞表位插入位点，通过PPV VLPs三维结构和 抗原表位分布图分析，我们推测loop 2，4区可作为外源表位基因插入位点；并在腺病毒 表达系统中表达验证，结果loop 2，4的缺失突变株均能表达出病毒样颗粒，初步验证loop 2，4区能容纳外源抗原决定簇。

本文重组PPVΔVP2病毒样颗粒可作为B细胞表位载体进行多价重组疫苗的研制，构 建可有效递呈不同来源B细胞表位的PPV VLPs技术平台，为发展同时抗一个或多个病原 的疫苗开辟了新的思路。

SEQUENCE LISTING

 

 

<110>  江苏省农业科学院

 

 

<120>  猪细小病毒样颗粒B细胞表位展示载体的分子设计

 

 

<130>  0

 

 

<160>  8    

 

 

<170>  PatentIn version 3.1

 

 

<210>  1

<211>  28

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  Loop11

<222>  (1)..(28)

<223> 

 

 

 

<400>  1

gtcgacatga gtgaaaatgt ggaacaac                                        28

 

 

<210>  2

<211>  19

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  Loop 22

<222>  (1)..(19)

<223> 

 

 

 

<400>  2

tggatttagg tttctgatg                                                  19

 

 

<210>  3

<211>  39

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  Loop23

<222>  (1)..(39)

<223> 

 

 

 

<400>  3

catcagaaac ctaaatccag actcaataca aacaggact                            39

 

 

<210>  4

<211>  27

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  Loop 14

<222>  (1)..(27)

<223> 

 

 

 

<400>  4

gccctcgagc tagtataatt ttcttgg                                         27

 

 

<210>  5

<211>  21

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  Loop 42

<222>  (1)..(21)

<223> 

 

 

 

<400>  5

ttgttgcttt ggagctcttc c                                               21

 

 

<210>  6

<211>  38

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  Loop 43

<222>  (1)..(38)

<223> 

 

 

 

<400>  6

ggaagagctc caaagcaaca acttttacct tcagatcc                             38

 

 

<210>  7

<211>  32

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  P1

<222>  (1)..(32)

<223> 

 

 

 

<400>  7

accggatcca tggggggggt tggtgtgtct ac                                   32

 

 

<210>  8

<211>  27

<212>  DNA

<213>  人工

 

 

<220>

<221>  P2

<222>  (1)..(27)

<223> 

 

 

 

<400>  8

atcctcgagc tagtataatt ttcttgg                                         27