一种鉴定不同养殖海区的经济海藻裙带菜配子体的方法

摘要

本发明涉及来自中国不同养殖海区的经济海藻裙带菜(Undariapinnatifida)配子体Rubisco基因及两侧大小亚基(rbcL和rbcS)部分DNA序列的获得及利用该序列对不同来源的裙带菜配子体进行鉴定的方法。本发明首先建立了一套裙带菜配子体高质量DNA的制备方法，接着对裙带菜不同配子体Rubisco基因及两侧大小亚基DNA序列进行了测序，获得了Rubisco基因全序列及其大小亚基(rbcL和rbcS)的部分序列(见序列附表)；并与Genbank中已经注册的裙带菜Rubisco基因序列进行了同源性比较，比较了不同来源裙带菜配子体Rubisco基因全序列及其大小亚基核苷酸位点差异，分析了中国不同养殖地点的裙带菜起始来源地，方法简便，从分子角度出发，使鉴定结果更准确、可靠。

说明书

技术领域

本发明涉及来自中国不同养殖海区的经济海藻裙带菜(Undariapinnatifida)配子体Rubisco基因及两侧大小亚基(rbcL和rbcS)部分DNA序列的获得及利用该序列对不同来源的裙带菜配子体进行鉴定的方法，也即获得经济海藻裙带菜(Undaria pinnatifida)配子体Rubisco基因全部序列和rbcL及rbcS亚基部分序列，及利用该序列鉴定不同来源的中国经济海藻裙带菜配子体的方法。

背景技术

裙带菜是海岸植物中个体较大，质柔味美，营养价值和经济价值较高的一种重要经济海藻，它是北太平洋特有种，多年来由于船舶运输的关系，它的配子体和幼孢子体被传播到世界各地。《中国海藻志》记载裙带菜有：无肋裙带菜(Undaria peterseniana)、叶囊裙带菜(U.undarioides)和裙带菜(U.pinnatifida Harv.Suringar)三种，后一种因有较高的食用价值而被广泛养殖。裙带菜营养价值较高，综合起来看，裙带菜干品中蛋白质含量在11％以上，最高可达22％；含糖分35％～40％；脂类0.5％～3％；灰分20％～38％，灰分中含Ca，Mg，Zn，Fe，Mn，Co，Ge，Se等各种矿质元素；裙带菜含有19种氨基酸，包括全部人体必需氨基酸；裙带菜还含有各种维生素，其中维生素K1含量可达到8μg/g；裙带菜的多糖组分较复杂，纤维素易于被人消化吸收。裙带菜的药用和保健作用也日益受到人们的重视。裙带菜还是重要的工业原料，综合利用可提取褐藻胶、碘、甘露醇和氯化钾等多种工业产品。除此之外，裙带菜还具有较高的经济价值，国际市场对裙带菜需求量的增加也证实了这一点。20世纪90年代初的统计表明，全世界裙带菜年产量约为9×10⁵t干品，产值为2×10⁸美元。近年来，裙带菜的市场需求不断扩大，应用范围不断扩展，显示出极好的市场潜力。

裙带菜是继海带和紫菜之后，从20世纪80年代中期开始在中国逐步形成的一个藻类养殖产业。到目前为止，尽管已先后在法国、英国、新西兰和澳大利亚发现了裙带菜，但裙带菜养殖产业主要集中在中国、日本和韩国。中国自然繁殖的裙带菜主要分布在浙江省舟山群岛的塖山岛附近，自然分布在大连附近及山东半岛地区的裙带菜则是早年从日本和朝鲜移植过来的。自从裙带菜雌雄配子体分离方法建立以来，随着养殖和杂交育种技术的发展，许多具有优良性状的裙带菜新品种在生产中得到了广泛应用。但是不同来源地的裙带菜或具有不同优良性状的同种裙带菜的配子体从肉眼是很难区分开来的，目前主要是借助显微镜观察。随着分子生物学的迅猛发展，一些分子标记技术诸如随机引物扩增多态性(RAPD)、限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)、扩增片段长度多态性(AFLP)和简单序列重复间区(ISSR)等已开始应用于重要经济海藻的鉴定和辅助育种。但是这几种标记方法稳定性和重复性不高、耗时耗力，极大的限制了它们在实际中的应用。

Rubisco基因(1，5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶)是1947年由Wildmen和Bonnor首先发现的。它具有催化CO₂和RuBP(1，5-二磷酸核酮糖)形成PGA(3-磷酸甘油酸)的功能，是光合作用过程中一种非常重要的酶。后续研究证实在植物与微生物之间、不同植物之间、不同微生物之间Rubisco结构是不同的，其形式是由大亚基(rbcL)和小亚基(rbcS)共同组成的L_xS_y。Rubisco基因大亚基分子量一般在50～60KD之间，是由叶绿体DNA编码，小亚基分子量一般在12～18KD之间，是由核DNA编码。不同植物间和同一物种内Rubisco基因及大小亚基DNA同源性程度不同，因此可以用于系统进化、亲缘关系分析和物种鉴定等相关研究领域。近年来，随着PCR技术的发展和直接测序技术在分子生物学研究中的广泛应用，Rubisco基因及其两侧的大小亚基DNA序列必将在植物科内属间、属下种间的亲缘关系鉴定和系统进化等研究中发挥重要的作用。

发明内容

本发明的目的是提供一种简便的鉴定中国不同养殖海区的经济海藻裙带菜配子体的方法，从分子角度出发，使鉴定结果更准确、可靠。本发明首先建立了一套裙带菜配子体高质量DNA的制备方法，接着对裙带菜不同配子体Rubisco基因及两侧大小亚基DNA序列进行了测序，获得了Rubisco基因全序列及其大小亚基(rbcL和rbcS)的部分序列(见序列附表)；并与Genbank中已经注册的裙带菜Rubisco基因序列进行了同源性比较，比较了不同来源裙带菜配子体Rubisco基因全序列及其大小亚基核苷酸位点差异，分析了中国不同养殖地点的裙带菜起始来源地。

一种鉴定来自中国不同养殖海区的经济海藻裙带菜配子体的方法，其利用海藻裙带菜配子体Rubisco基因及两侧大小亚基(rbcL和rbcS)部分的DNA序列对不同来源(养殖海区)的裙带菜配子体进行鉴定。

具体过程为：

1)提取需要鉴定的海藻裙带菜总DNA：进行藻体材料收集、鉴定和保存工作，包括裙带菜雌雄配子体的分离，从确定的藻体中提取DNA(取培养中的新鲜健康藻体材料，用无菌水处理以除去杂质，在液氮种研磨成粉末，用CTAB抽提法提取总DNA)；

2)以获得的DNA为模板，以寡核苷酸作为聚合酶链式反应(PCR)的引物，扩增Rubisco基因及其两侧大小亚基(rbcL和rbcS)部分序列，所用的引物参照相近物种Rubisco基因两侧大小亚基的保守序列进行人工合成；

利用特异引物P1和P4的序列对总DNA进行Rubisco基因及其两侧大小亚基PCR扩增反应，

P1和P4的序列分别为：正向P1为5’GCCAAATGCACCAACTTCTT3’，位于rbcL上，反向P4为5’AGACCCCATAATTCCC3’，位于rbcS上；并以ddH₂O代替模板DNA做空白对照；

3)对PCR扩增产物进行纯化；

4)应用直接测序技术对对纯化后的PCR产物测序；

5)对测定序列后的DNA序列数据分析(系统学分析)：用对位排列软件Clustal W和Genedoc进行对位排列，并辅以人工校对，用系统进化分析软件MEGA2.1和PHYLIP3.57分别分析各样品DNA序列与数据库中各个序列间的差异，进行亲缘和进化关系分析。

所述用于Rubisco基因及其两侧大小亚基扩增的反应液20μL中含10mmol/L Tris-HCl，pH8.3，50mmol/L KCl，1.5mmol/L MgCl₂，Taqpolymerase 1U，4种dNTP各2mmol/L，两个引物各4-6mmol/L，DNA模板40-70ng；反应循环参数为：96℃预变性3分钟；94℃2分钟，53-57℃10秒钟，72℃1分钟；2个循环；94℃10秒钟，53-57℃10秒钟，72℃2分钟，33-38个循环；72℃延伸5分钟；扩增后测序所设计的引物为：

P1：5’GCCAAATGCACCAACTTCTT3’，P4：5’AGACCCCATAATTCCC3’。每一个样品至少重复2～3次。

裙带菜配子体保种因为一些主观和客观因素的影响，存在材料起始来源不明确的问题，本发明从分子水平上对该问题进行了解答。本发明提供了一种获得经济海藻裙带菜配子体的Rubisco基因及其两侧大小亚基(rbcL和rbcS)部分DNA序列的方法，并利用该序列对中国不同来源的经济海藻裙带菜进行鉴定和探讨这些不同养殖地点所用裙带菜的初始来源地。

海带和裙带菜都属于褐藻门，褐子纲，海带目，分属于海带科和翅藻科，它们的生活史比较相似，在养殖过程中都要经过配子体保种阶段，而且它们的配子体从外形上是很难区分的。本发明实施例给出了利用同源性较好的引物P1和P4比较裙带菜和海带配子体Rubisco基因扩增图谱差异；为海带和裙带菜配子体的鉴定提供了很好的依据。

附图说明

图1为本发明用Rubisco基因鉴别裙带菜和海带配子体的电泳图谱，其中1-17和19-24均为裙带菜样品，18为海带样品。

具体实施方式

实施例

下面详细描述所述方法：

(1)总DNA提取

首先，对培养的裙带菜配子体进行清洗，除去杂物，然后用吸水纸吸干水份。接着加液氮研磨成粉末，转移到预热的提取缓冲液[10mmol L^-1Tris.HCl，pH8.0，20mmol L^-1 ethylenediaminetetra-acetic acid(EDTA)，1.4MNaCl，3％ cetyltrimethyl ammonium bromide(CTAB)]中，加入β巯基乙醇，在65℃水浴1h加入1/3体积的2M(pH5.5)的KAC，冰浴15min后在10000rpm下离心10min。取上清液加氯仿∶异戊醇(24∶1)抽提两次，接着取上清液加2/3体积异丙醇沉淀DNA。DNA溶解在TE中，加入Rnase除去RNA后用氯仿∶异戊醇(24∶1)抽提一次，加2/3体积异丙醇沉淀DNA，干燥后的DNA重新溶解在TE中，-20℃保存。琼脂糖凝胶电泳后染色显示提取的基因组DNA大小在23Kb左右，OD_260/280比值在1.60-1.90之间。

(2)PCR扩增

裙带菜配子体Rubisco基因及其两侧大小亚基扩增的引物为P1和P4，序列如下：P1(正向)为5’GCCAAATGCACCAACTTCTT3’，位于rbcL上，P4(反向)为5’AGACCCCATAATTCCC3’，位于rbcS上。PCR反应扩增反应在20μL的体系中完成，反应液含10mmol/L Tris-HCl，pH8.3，50mmol/L KCl，1.5mmol/LMgCl₂，Taq polymerase 1U，4种dNTP各2mmol/L，两个引物各5mmol/L，DNA模板约50ng。反应循环参数为96℃预变性3分钟；94℃2分钟，55℃10秒钟，72℃2分钟，2个循环；94℃10秒钟，55℃10秒钟，72℃2分钟，35个循环；72℃延伸5分钟。以ddH₂O代替模板DNA做空白对照。

(3)PCR产物纯化

PCR产物用EZ spin column PCR product purification kit(生工，上海)进行纯化，具体操作按试剂盒使用指南进行。

(4)DNA序列测定

用BigDye^TM测序试剂盒进行测序反应，测序反应参数为：Mix 1μL，纯化后的DNA约30-50ng，Primer 1.5pmol，buffer 1.2μL，ddH₂O适量。测序反应条件为：95℃1min，95℃30s，50℃30s，60℃4min，总共35各循环。用ABIPRISM377-96全自动测序仪上进行序列测定。

(5)DNA序列数据分析

Rubisco基因序列的起止范围参照Genbank中已经注册的部分海带和裙带菜Rubisco基因序列，所得序列输入计算机后用Clustal W和Genedoc软件进行比对排列，并辅以人工校对。用MEGA2.1和PHYLIP3.57分析软件包分别分析各样品DNA序列之间的差异，并构建亲缘关系树，根据系统进化树和每个个体之间的遗传分化距离，结合Genbank中已有的数列，推测中国不同养殖地点的裙带菜初始起源地。

发明人从中国沿海不同养殖海域获得包括辽宁大连，山东青岛、威海、荣成和日照，日本南型和北型，大连水产学院及课题组自己分离得到的裙带菜(Undaria pinnatifida)配子体共18个样品(包括野生型和养殖品系)，它们各自具有不同的生产性状，含盖了目前中国国内的裙带菜所有养殖类型，所有样品都经过相关领域专家的鉴定。

1)采用上述方法对18个待检测植物的样品总DNA提取：将待检样品用无菌水冲洗干净，除去杂质，在液氮中研成粉末，根据本专利提供的CTAB法提取基因组总DNA；

2)模板DNA的质量检测

运用引物P1和P4(P1、P4序列见上述方法步骤2中)对待检样品总DNA进行扩增，检测是否能扩增出目的片断，检验标准主要依据片段的亮度和片段分子量大小，以验证模板DNA的质量、调整模板DNA的浓度及PCR反应体系的组成；PCR扩增反应在20μL的体系中完成，反应液含10mmol/L Tris-HCl，pH8.3，50mmol/L KCl，1.5mmol/L MgCl₂，Taqpolymerase 1U，4种dNTP各2mmol/L，两个引物各5mmol/L，DNA模板约50ng。反应循环参数为96℃预变性3分钟；94℃1分钟，53-57℃10秒钟，72℃1分钟；2个循环；94℃10秒钟，53-57℃10秒钟，72℃1分钟，30-38个循环；72℃延伸5分钟。以ddH₂O代替模板DNA做空白对照。

3)运用同源性引物P1和P4对模板DNA进行扩增；电泳结果显示扩增产物非常理想(如图1所示)，所以同源性引物P1和P4能用于海带目海藻海带和裙带菜的鉴定分离。

(不同来源的中国经济海藻裙带菜配子体Rubisco基因的全序列(包括rbcL和rbcS部分序列))

1.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：539碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：生长在水温较高、水层较浅处的耐高温种，源于日本南型(明门)的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雄配子体Rubisco基因全序列(1-244，rbcL；245-512；Rubisco；513-539，rbcS)

序列描述：

TACTATAGGTCACCCTGATGGTATTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCT

CTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTC

CTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGA

TTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTG

AACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGT

TAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCT

ACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTATT

ATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGT

AAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAG

GAATTTGAATAGTG ATGAGAGTTACACAAGGATGTTTTTCG

2.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：579碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：生长在水温较高、水层较浅处的耐高温种，源于日本南型(明门)的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雌配子体Rubisco基因全序列(1-268，rbcL；269-536；Rubisco；537-579，rbcS)

序列描述：

TGTGGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGATGGTATTCAATCTG

GTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAAGG

TCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTTGT

GGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACACTTC

AACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACTGAA

ATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGCTAG

AAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATAAAA

TTAAGACTTAACTTTAAATTTATTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCCAGAT

TATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAATAA

AATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACAAGGA

TGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAA

3.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：582碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体较大，叶片上毛囊多，源于山东青岛野生种的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雄配子体Rubisco基因全序列(1-219，rbcL；220-487；Rubisco；488-582，rbcS)

序列描述：

CAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTA

ATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGC

TACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGT

ACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTA

TACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAAT

AGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTT

ATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACC

CCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAA

AAATAAAATTCCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGGATGAGAGTTAC

ACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACAA

GTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGG

4.序列表SEQ TD NO.1的信息

特征：长度：638碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：适合于低水温水域生长，不耐高温的养殖品系，源于日本北方的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雄配子体Rubisco基因全序列(1-265，rbcL；266-533；Rubisco；534-638，rbcS)

序列描述：

GGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGATGGTATTCAATCTGGTG

CAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAAGGTCG

TGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTTGTGGT

CCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACACTTCAA

CAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACTGAAAT

TAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGCTAGAA

AATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATAAAATT

AAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCCAGATTA

TTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAATAAAA

TTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACAAGGATGT

TTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACAAGTTGCTTATGC

TATGTCAAAAGGGTGGGCTGTTAGTGTA

5.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：609碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：适合于低水温水域生长，不耐高温的养殖品系，源于日本北方的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雌配子体Rubisco基因全序列(1-255，rbcL；256-523；Rubisco；524-609，rbcS)

序列描述：

GGTGTGGGTACTATTGGTCCACCCTGATGGTATTCAATCTGGGTGCAACCAGCAA

ACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAAGGTCGTGATTATGTT

GGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAG

CAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACACTTCAACAGATACACC

TGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACTGAAATTAAACTCATA

AAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGCTAGAAAATATATCTA

ATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATAAAATTAAGACTTAAC

TTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCCAGATTATTTTAAGTGA

AAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAATAAAATTTCTATAAT

TTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACAAGGATGTTTTTCGTTTT

TACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACAAGTTGCTTATGCTATGTCAAA

6.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：621碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：孢子叶成熟早，低温养殖品系，源于中国大连的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雄配子体Rubisco基因全序列(1-270，rbcL；271-538；Rubisco；539-621，rbcS)

序列描述：

GATGTGGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGATGGTATTCAATC

TGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAA

GGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTT

GTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACAC

TTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACT

GAAATTAAACTCATAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGC

TAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATA

AAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCCA

GATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAA

TAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACAA

GGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACAAGTTG

CTTATGCTATGTC

7.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：674碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：孢子叶成熟早，低温养殖品系，源于中国大连的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雌配子体Rubisco基因全序列(1-276，rbcL；277-544；Rubisco；545-674，rbcS)

序列描述：

GGGGATGATGTGGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGATGGTA

TTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGT

AATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGG

CTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAG

TACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGT

ATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAA

ATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTG

TTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATA

CCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACT

AAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTA

CACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACA

AGTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCTGTTAGTGTAGAATGGACAGATGAT

CCACATCCAC

8.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：641碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体生长快，成熟早，低温养殖品系，源于山东威海的的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雄配子体Rubisco基因全序列(1-275，rbcL；276-543；Rubisco；544-641，rbcS)

序列描述：

GGGGATGATGTGGTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGATGGTAT

TCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGT

AATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGG

CTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAG

TACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGT

ATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAA

ATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTG

TTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATA

CCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACT

AAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTA

CACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACA

AGTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCTGG

9.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：675碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体叶片较宽，成熟早，低温养殖品系，源于山东荣成的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雄配子体Rubisco基因全序列(1-277，rbcL；278-545；Rubisco；546-675，rbcS)

序列描述：

GGGGATGATGTGGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGGATGGT

ATTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTC

GTAATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGC

GGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTG

AGTACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATA

GTATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTA

AATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATT

GTTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAAT

ACCCCAGATTATTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAAC

TAAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTT

ACACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAAC

AAGTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCTGTTAGTGTAGAATGGACAGATGA

TCCACATCCAC

10.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：669碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体叶片较宽，成熟早，低温养殖品系，源于山东荣成的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雌配子体Rubisco基因全序列(1-276，rbcL；277-544；Rubisco；545-669，rbcS)

序列描述：

GGGGATGATGTGGTTCTACAATTTGGTGGGGGTACTATTGGTCACCCTGATGGTA

TTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGT

AATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGG

CTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAG

TACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGT

ATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAA

ATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTG

TTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATA

CCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACT

AAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTA

CACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACA

AGTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCTGTTAGTGTAGGATGGACAGATGAT

CCACA

11.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：603碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体较宽，成熟晚，较耐高温的养殖品系，源于山东日照的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雄配子体Rubisco基因全序列(1-271，rbcL；272-539；Rubisco；540-603，rbcS)

序列描述：

GATGTGGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGGATGGTATTCAAT

CTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGA

AGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACT

TGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACA

CTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATAC

TGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAG

CTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTAT

AAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCC

AGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAA

ATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACA

AGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAAC

12.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：663碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体较宽，成熟晚，较耐高温的养殖品系，源于山东日照的裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)雌配子体Rubisco基因全序列(1-284，rbcL；285-552；Rubisco；553-663，rbcS)

序列描述：

TCTATTTAGGGGATGATGTGGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCT

GATGGTATTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTC

TAGCTCGTAATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAA

TGCAGCGGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATT

ACTTTTGAGTACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAA

GCAAATAGTATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGT

TATATTTAAATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAA

GTGATATTGTTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAA

TACTTAATACCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAG

TATATAACTAAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGAT

GAGAGTTACACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATT

AAAAAACAAGTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCTGTTAGTGTAGAATGG

13.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：659碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：引进的日本北方养殖品系，在中国养殖，通过采孢子分离获得的裙带菜雄配子体(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)Rubisco基因全序列(1-273，rbcL；274-541；Rubisco；542-659，rbcS)

序列描述：

ATGATGTGGTTCTACAATTTGGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGAATGGTATTCA

ATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAAT

GAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTA

CTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTAC

ACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATA

CTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATA

GCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTA

TAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCC

CAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAA

AATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACAC

AAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACAAGT

TGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCTGTTAGTGTAGAATGGACAGATG

14.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：636碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：引进的日本北方养殖品系，在中国养殖，通过采孢子分离获得的裙带菜雌配子体(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)Rubisco基因全序列(1-246，rbcL；247-514；Rubisco；515-636，rbcS)

序列描述：

GGTACTATTGGTCACCCTGATGGTATTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTG

CTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGG

TCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTA

GATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGT

TGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAA

GTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTAT

CTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTG

TTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGA

GTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAA

GGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTT

AACTGATGAGCAAATTAAAAAACAAGTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCT

GTTAGTGTAGAATGGACAGATGATCC

15.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：624碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体小，比较嫩，源于山东青岛的野生种的裙带菜(Undariapinnatifida Harv.Suringar)雄配字体Rubisco基因全序列(1-228，rbcL；229-496；Rubisco；497-624，rbcS)

序列描述：

GATGGTATTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTC

TAGCTCGTAATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAA

TGCAGCGGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATT

ACTTTTGAGTACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAA

GCAAATAGTATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGT

TATATTTAAATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAA

GTGATATTGTTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAAAA

TACTTAATACCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAG

TATATAACTAAAAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGAT

GAGAGTTACACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTGATGAGCAAATT

AAAAAACAAGTTGCTTATGCTATGTCAAAAGGGTGGGCTGTTAGTGTAGAATGGA

CAGATGATCCACATCC

16.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：620碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体小，比较嫩，源于山东青岛的野生种的裙带菜(Undariapinnatifida Harv.Suringar)雌配字体Rubisco基因全序列(1-252，rbcL；253-520；Rubisco；521-620，rbcS)

序列描述：

GGTGGTGGTACTATTGGTCACCCTGATGGTATTCAATCTGGTGCAACAGCAAACC

GTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAAGGTCGTGATTATGTTGGA

GAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAG

CGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACACTTCAACAGATACACCTGA

TTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACTGAAATTAAACTCATAAAA

GATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGCTAGAAAATATATCTAATA

ATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATAAAATTAAGACTTAACTTT

AAATTTGTTATAATTTTAGAAAAATACTTAATACCCCAGATTATTTTAAGTGAAA

GTAGAGAGTAAATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAATAAAATTTCTATAATTT

ATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACAAGGATGTTTTCGTTTTTA

CCAGATTTAACTGATGAGCAAATTAAAAAACAAGTTGCTTATGCTATGTCAAAAG

GGTGGGCTGTTA

17.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：534碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体较大，产量高，源于大连水产学院的裙带菜(Undariapinnatifid Harv.Suringar)雄配子体的Rubisco基因全序列(1-219，rbcL；220-487；Rubisco；488-534，rbcS)

序列描述：

CAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCTAGAATCTATGGTTCTAGCTCGTA

ATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCTGAAATCTTACGTAATGCAGCGGC

TACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATTTATGGAAAGATATTACTTTTGAGT

ACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGAACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTA

TACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTTAAATTAATTCTAGTTATATTTAAAT

AGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTACTTTATTATTTAAAGTGATATTGTT

ATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTATAATTTTAGAAGAATACTTAATACC

CCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTAAATAACGATTTTAGTATATAACTAA

AAATAAAATTTCTATAATTTATCTTTAAGGAATTTGAATAGTGATGGAGAGTTAC

ACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAACTG

18.序列表SEQ ID NO.1的信息

特征：长度：571碱基对

类型：核酸

链型：双链

分子类型：cDNA

拓扑结构：线形

来源：藻体较大，产量高，源于大连水产学院的裙带菜(Undariapinnatifida Harv.Suringar)雌配子体的Rubisco基因全序列(1-243，rbcL；244-512；Rubisco；513-571，rbcS)

序列描述：

ACTATTGGTCACCCTGATGGTATTCAATCTGGTGCAACAGCAAACCGTGTTGCTCT

AGAATCTATGGTTCTAGCTCGTAATGAAGGTCGTGATTATGTTGGAGAAGGTCCT

GAAATCTTACGTAATGCAGCGGCTACTTGTGGTCCTTTAAAAGCAGCGTTAGATT

TATGGAAAGATATTACTTTTGAGTACACTTCAACAGATACACCTGATTTCGTTGA

ACTTCCAACTGAAAGCAAATAGTATACTGAAATTAAACTCATAAAAGATTAAGTT

AAATTAATTCTAGTTATATTTAAATAGCTAGAAAATATATCTAATAATTTTATCTA

CTTTATTATTTAAAGTGATATTGTTATAAAATTAAGACTTAACTTTAAATTTGTTA

TAATTTTAGAAAAATACTTAATAGCCCAGATTATTTTAAGTGAAAGTAGAGAGTA

AATAAAAATTTTAGTATATAACTAAAAATAAAATTTCTATAATTTATCCTTTAAGG

AATTTGAATAGTGATGAGAGTTACACAAGGATGTTTTTCGTTTTTACCAGATTTAA

CTGGATGAGCAAATTA

                   SEQUENCE LISTING

<110>中国科学院海洋研究所

<120>一种鉴定不同养殖海区的经济海藻裙带菜配子体的方法

<130>

<160>18

<170>PatentIn version 3.1

<210>1

<211>539

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(244)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(245)..(512)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(513)..(539)

<223>

<400>1

tactataggt caccctgatg gtattcaatc tggtgcaaca gcaaaccgtg ttgctctaga    60

atctatggtt ctagctcgta atgaaggtcg tgattatgtt ggagaaggtc ctgaaatctt    120

acgtaatgca gcggctactt gtggtccttt aaaagcagcg ttagatttat ggaaagatat    180

tacttttgag tacacttcaa cagatacacc tgatttcgtt gaacttccaa ctgaaagcaa    240

atagtatact gaaattaaac tcataaaaga ttaagttaaa ttaattctag ttatatttaa    300

atagctagaa aatatatcta ataattttat ctactttatt atttaaagtg atattgttat    360

aaaattaaga cttaacttta aatttattat aattttagaa aaatacttaa taccccagat    420

 tattttaagt gaaagtagag agtaaataaa aattttagta tataactaaa aataaaattt    480

 ctataattta tctttaagga atttgaatag tgatgagagt tacacaagga tgtttttcg     539

<210>2

<211>579

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(268)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(269)..(536)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(537)..(579)

<223>

<400>2

tgtggttcta caatttggtg gtggtactat tggtcaccct gatggtattc aatctggtgc    60

aacagcaaac cgtgttgctc tagaatctat ggttctagct cgtaatgaag gtcgtgatta    120

tgttggagaa ggtcctgaaa tcttacgtaa tgcagcggct acttgtggtc ctttaaaagc    180

agcgttagat ttatggaaag atattacttt tgagtacact tcaacagata cacctgattt    240

cgttgaactt ccaactgaaa gcaaatagta tactgaaatt aaactcataa aagattaagt    300

taaattaatt ctagttatat ttaaatagct agaaaatata tctaataatt ttatctactt    360

tattatttaa agtgatattg ttataaaatt aagacttaac tttaaattta ttataatttt    420

agaaaaatac ttaatacccc agattatttt aagtgaaagt agagagtaaa taaaaatttt    480

agtatataac taaaaataaa atttctataa tttatcttta aggaatttga atagtgatga    540

gagttacaca aggatgtttt tcgtttttac cagatttaa                           579

<210>3

<211>582

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(219)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(220)..(487)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(488)..(582)

<223>

<400>3

caatctggtg caacagcaaa ccgtgttgct ctagaatcta tggttctagc tcgtaatgaa    60

ggtcgtgatt atgttggaga aggtcctgaa atcttacgta atgcagcggc tacttgtggt    120

cctttaaaag cagcgttaga tttatggaaa gatattactt ttgagtacac ttcaacagat    180

acacctgatt tcgttgaact tccaactgaa agcaaatagt atactgaaat taaactcata    240

aaagattaag ttaaattaat tctagttata tttaaatagc tagaaaatat atctaataat    300

tttatctact ttattattta aagtgatatt gttataaaat taagacttaa ctttaaattt    360

gttataattt tagaaaaata cttaataccc cagattattt taagtgaaag tagagagtaa    420

ataaaaattt tagtatataa ctaaaaataa aattcctata atttatcttt aaggaatttg    480

aatagtggat gagagttaca caaggatgtt tttcgttttt accagattta actgatgagc    540

aaattaaaaa acaagttgct tatgctatgt caaaagggtg gg                       582

<210>4

<211>638

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcl

<222>(1)..(265)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(266)..(533)

<223>

<220>

<221>rbcs

<222>(534)..(638)

<223>

<400>4

ggttctacaa tttggtggtg gtactattgg tcaccctgat ggtattcaat ctggtgcaac    60

agcaaaccgt gttgctctag aatctatggt tctagctcgt aatgaaggtc gtgattatgt    120

tggagaaggt cctgaaatct tacgtaatgc agcggctact tgtggtcctt taaaagcagc    180

gttagattta tggaaagata ttacttttga gtacacttca acagatacac ctgatttcgt    240

tgaacttcca actgaaagca aatagtatac tgaaattaaa ctcataaaag attaagttaa    300

attaattcta gttatattta aatagctaga aaatatatct aataatttta tctactttat    360

tatttaaagt gatattgtta taaaattaag acttaacttt aaatttgtta taattttaga    420

aaaatactta ataccccaga ttattttaag tgaaagtaga gagtaaataa aaattttagt    480

atataactaa aaataaaatt tctataattt atctttaagg aatttgaata gtgatgagag    540

ttacacaagg atgtttttcg tttttaccag atttaactga tgagcaaatt aaaaaacaag    600

ttgcttatgc tatgtcaaaa gggtgggctg ttagtgta                            638

<210>5

<211>609

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcl

<222>(1)..(255)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(256)..(523)

<223>

<220>

<221>rbcs

<222>(524)..(609)

<223>

<400>5

ggtgtgggta ctattggtcc accctgatgg tattcaatct gggtgcaacc agcaaaccgt    60

gttgctctag aatctatggt tctagctcgt aatgaaggtc gtgattatgt tggagaaggt    120

cctgaaatct tacgtaatgc agcggctact tgtggtcctt taaaagcagc gttagattta    180

tggaaagata ttacttttga gtacacttca acagatacac ctgatttcgt tgaacttcca    240

actgaaagca aatagtatac tgaaattaaa ctcataaaag attaagttaa attaattcta    300

gttatattta aatagctaga aaatatatct aataatttta tctactttat tatttaaagt    360

gatattgtta taaaattaag acttaacttt aaatttgtta taattttaga aaaatactta    420

ataccccaga ttattttaag tgaaagtaga gagtaaataa aaattttagt atataactaa    480

aaataaaatt tctataattt atctttaagg aatttgaata gtgatgagag ttacacaagg    540

atgtttttcg tttttaccag atttaactga tgagcaaatt aaaaaacaag ttgcttatgc    600

tatgtcaaa                                                            609

<210>6

<211>621

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcl

<222>(1)..(270)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(271)..(538)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(539)..(621)

<223>

<400>6

gatgtggttc tacaatttgg tggtggtact attggtcacc ctgatggtat tcaatctggt    60

gcaacagcaa accgtgttgc tctagaatct atggttctag ctcgtaatga aggtcgtgat    120

tatgttggag aaggtcctga aatcttacgt aatgcagcgg ctacttgtgg tcctttaaaa    180

gcagcgttag atttatggaa agatattact tttgagtaca cttcaacaga tacacctgat    240

ttcgttgaac ttccaactga aagcaaatag tatactgaaa ttaaactcat aaaagattaa    300

gttaaattaa ttctagttat atttaaatag ctagaaaata tatctaataa ttttatctac    360

tttattattt aaagtgatat tgttataaaa ttaagactta actttaaatt tgttataatt    420

ttagaaaaat acttaatacc ccagattatt ttaagtgaaa gtagagagta aataaaaatt    480

ttagtatata actaaaaata aaatttctat aatttatctt taaggaattt gaatagtgat    540

gagagttaca caaggatgtt tttcgttttt accagattta actgatgagc aaattaaaaa    600

acaagttgct tatgctatgt c                                              621

<210>7

<211>674

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(276)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(277)..(544)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(545)..(674)

<223>

<400>7

ggggatgatg tggttctaca atttggtggt ggtactattg gtcaccctga tggtattcaa    60

tctggtgcaa cagcaaaccg tgttgctcta gaatctatgg ttctagctcg taatgaaggt    120

cgtgattatg ttggagaagg tcctgaaatc ttacgtaatg cagcggctac ttgtggtcct    180

ttaaaagcag cgttagattt atggaaagat attacttttg agtacacttc aacagataca    240

cctgatttcg ttgaacttcc aactgaaagc aaatagtata ctgaaattaa actcataaaa    300

gattaagtta aattaattct agttatattt aaatagctag aaaatatatc taataatttt    360

atctacttta ttatttaaag tgatattgtt ataaaattaa gacttaactt taaatttgtt    420

ataattttag aaaaatactt aataccccag attattttaa gtgaaagtag agagtaaata    480

aaaattttag tatataacta aaaataaaat ttctataatt tatctttaag gaatttgaat    540

agtgatgaga gttacacaag gatgtttttc gtttttacca gatttaactg atgagcaaat    600

taaaaaacaa gttgcttatg ctatgtcaaa agggtgggct gttagtgtag aatggacaga    660

tgatccacat ccac                                                      674

<210>8

<211>641

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(275)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(276)..(543)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(544)..(641)

<223>

<400>8

ggggatgatg tggtctacaa tttggtggtg gtactattgg tcaccctgat ggtattcaat    60

ctggtgcaac agcaaaccgt gttgctctag aatctatggt tctagctcgt aatgaaggtc    120

gtgattatgt tggagaaggt cctgaaatct tacgtaatgc agcggctact tgtggtcctt    180

taaaagcagc gttagattta tggaaagata ttacttttga gtacacttca acagatacac    240

ctgatttcgt tgaacttcca actgaaagca aatagtatac tgaaattaaa ctcataaaag    300

attaagttaa attaattcta gttatattta aatagctaga aaatatatct aataatttta    360

tctactttat tatttaaagt gatattgtta taaaattaag acttaacttt aaatttgtta    420

taattttaga aaaatactta ataccccaga ttattttaag tgaaagtaga gagtaaataa    480

aaattttagt atataactaa aaataaaatt tctataattt atctttaagg aatttgaata    540

gtgatgagag ttacacaagg atgtttttcg tttttaccag atttaactga tgagcaaatt    600

aaaaaacaag ttgcttatgc tatgtcaaaa gggtgggctg g                        641

<210>9

<211>675

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(277)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(278)..(545)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(546)..(675)

<223>

<400>9

ggggatgatg tggttctaca atttggtggt ggtactattg gtcaccctgg atggtattca    60

atctggtgca acagcaaacc gtgttgctct agaatctatg gttctagctc gtaatgaagg    120

tcgtgattat gttggagaag gtcctgaaat cttacgtaat gcagcggcta cttgtggtcc    180

tttaaaagca gcgttagatt tatggaaaga tattactttt gagtacactt caacagatac    240

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tataatttta gaaaaatact taatacccca gattatttta agtgaaagta gagagtaaat    480

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atgatccaca tccac                                                     675

<210>10

<211>669

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(276)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(277)..(544)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(545)..(669)

<223>

<400>10

ggggatgatg tggttctaca atttggtggg ggtactattg gtcaccctga tggtattcaa    60

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taaaaaacaa gttgcttatg ctatgtcaaa agggtgggct gttagtgtag gatggacaga    660

tgatccaca                                                            669

<210>11

<211>603

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(271)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(272)..(539)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(540)..(603)

<223>

<400>11

gatgtggttc tacaatttgg tggtggtact attggtcacc ctggatggta ttcaatctgg    60

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aac                                                                  603

<210>12

<211>663

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(284)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(285)..(552)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(553)..(663)

<223>

<400>12

tctatttagg ggatgatgtg gttctacaat ttggtggtgg tactattggt caccctgatg    60

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agtaaataaa aattttagta tataactaaa aataaaattt ctataattta tctttaagga    540

atttgaatag tgatgagagt tacacaagga tgtttttcgt ttttaccaga tttaactgat    600

gagcaaatta aaaaacaagt tgcttatgct atgtcaaaag ggtgggctgt tagtgtagaa    660

tgg                                                                  663

<210>13

<211>659

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(273)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(274)..(541)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(542)..(659)

<223>

<400>13

atgatgtggt tctacaattt ggtggtggta ctattggtca ccctgaatgg tattcaatct    60

ggtgcaacag caaaccgtgt tgctctagaa tctatggttc tagctcgtaa tgaaggtcgt    120

gattatgttg gagaaggtcc tgaaatctta cgtaatgcag cggctacttg tggtccttta    180

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gatttcgttg aacttccaac tgaaagcaaa tagtatactg aaattaaact cataaaagat    300

taagttaaat taattctagt tatatttaaa tagctagaaa atatatctaa taattttatc    360

tactttatta tttaaagtga tattgttata aaattaagac ttaactttaa atttgttata    420

attttagaaa aatacttaat accccagatt attttaagtg aaagtagaga gtaaataaaa    480

attttagtat ataactaaaa ataaaatttc tataatttat ctttaaggaa tttgaatagt    540

gatgagagtt acacaaggat gtttttcgtt tttaccagat ttaactgatg agcaaattaa    600

aaaacaagtt gcttatgcta tgtcaaaagg gtgggctgtt agtgtagaat ggacagatg     659

<210>14

<211>636

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(246)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(247)..(514)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(515)..(636)

<223>

<400>14

ggtactattg gtcaccctga tggtattcaa tctggtgcaa cagcaaaccg tgttgctcta    60

gaatctatgg ttctagctcg taatgaaggt cgtgattatg ttggagaagg tcctgaaatc    120

ttacgtaatg cagcggctac ttgtggtcct ttaaaagcag cgttagattt atggaaagat    180

attacttttg agtacacttc aacagataca cctgatttcg ttgaacttcc aactgaaagc    240

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attattttaa gtgaaagtag agagtaaata aaaattttag tatataacta aaaataaaat    480

ttctataatt tatctttaag gaatttgaat agtgatgaga gttacacaag gatgtttttc    540

gtttttacca gatttaactg atgagcaaat taaaaaacaa gttgcttatg ctatgtcaaa    600

agggtgggct gttagtgtag aatggacaga tgatcc                              636

<210>15

<211>624

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(228)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(229)..(496)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(497)..(624)

<223>

<400>15

gatggtattc aatctggtgc aacagcaaac cgtgttgctc tagaatctat ggttctagct    60

cgtaatgaag gtcgtgatta tgttggagaa ggtcctgaaa tcttacgtaa tgcagcggct    120

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<210>16

<211>620

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(252)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(253)..(520)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(521)..(620)

<223>

<400>16

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gaaagcaaat agtatactga aattaaactc ataaaagatt aagttaaatt aattctagtt    300

atatttaaat agctagaaaa tatatctaat aattttatct actttattat ttaaagtgat    360

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<210>17

<211>534

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(219)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(220)..(487)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(488)..(534)

<223>

<400>17

caatctggtg caacagcaaa ccgtgttgct ctagaatcta tggttctagc tcgtaatgaa    60

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aatagtgatg gagagttaca caaggatgtt tttcgttttt accagattta actg          534

<210>18

<211>571

<212>DNA

<213>裙带菜(Undaria pinnatifida Harv.Suringar)

<220>

<221>rbcL

<222>(1)..(243)

<223>

<220>

<221>Rubisco

<222>(244)..(512)

<223>

<220>

<221>rbcS

<222>(513)..(571)

<223>

<400>18

actattggtc accctgatgg tattcaatct ggtgcaacag caaaccgtgt tgctctagaa    60

tctatggttc tagctcgtaa tgaaggtcgt gattatgttg gagaaggtcc tgaaatctta    120

cgtaatgcag cggctacttg tggtccttta aaagcagcgt tagatttatg gaaagatatt    180

acttttgagt acacttcaac agatacacct gatttcgttg aacttccaac tgaaagcaaa    240

tagtatactg aaattaaact cataaaagat taagttaaat taattctagt tatatttaaa    300

tagctagaaa atatatctaa taattttatc tactttatta tttaaagtga tattgttata    360

aaattaagac ttaactttaa atttgttata attttagaaa aatacttaat agcccagatt    420

attttaagtg aaagtagaga gtaaataaaa attttagtat ataactaaaa ataaaatttc    480

tataatttat cctttaagga atttgaatag tgatgagagt tacacaagga tgtttttcgt    540

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