一种基于全基因组SNP信息追溯水牛血统来源以及进行基因组选配的方法

摘要

本发明提供一种基于全基因组SNP信息追溯水牛血统来源以及基因组选配的方法，包括以下步骤：从待血统测验的水牛个体中提取DNA并测序，通过从数据库中下载世界主要水牛品种的二代测序数据，得到基因组SNP的基因型信息；将基因组SNP位点进行质控筛选，选取SNP位点；将获得的SNP信息合并，将SNP数据转换为PLINK的ped格式，进行STUCTURE分析，预设不同K值，推测亚群类型；计算待测水牛之间的近交系数，为后续基因组选配提供基础。本发明能够对血统进行更准确地追溯；新的追溯方法按比例显示各种组成成分，可依此对水牛选配，提升后代生产性能；通过计算个体之间亲缘关系，降低近亲配种概率。