FFPE样本DNA的质量评估方法及文库构建方法

摘要

本发明提供了一种FFPE样本的质量评估方法及文库构建方法。评估方法包括：以FFPE样本DNA为模板，采用ddPCR的方法对管家基因进行扩增，得到扩增产物的有效扩增模板数；对FFPE样本DNA进行电泳完整性检测；根据有效扩增模板数及电泳完整性检测的片段大小，对FFPE样本DNA的质量进行评估。通过对FFPE样本DNA中的管家基因进行扩增，用数字PCR的方法对其DNA进行精确定量，确定有效扩增的模板数。再综合电泳完整性的分析，对FFPE样本的质量有一个全方位、精确的评估，为后续搭配合适的建库方案提供更准确的指导方向，提高建库的成功率，进而提高下机数据的有效利用率。