一种基于长片段测序检测HIV耐药位点突变序列多样性的方法

摘要

本发明公开了一种基于长片段测序检测HIV耐药位点突变序列多样性的方法，涉及核酸检测领域，方法包括HIV病毒RNA抽提，利用随机引物进行反转录形成cDNA，以cDNA为模板，根据HIV的耐药位点序列所设计的引物进行第一轮PCR扩增目的片段；以第一轮PCR产物为模板，用第二轮扩增引物进行第二轮扩增得到第二轮扩增产物；以第二轮的扩增产物为模板进行第三轮扩增获得扩增产物；对第三轮扩增产物进行纯化定量，等摩尔量混合后进行三代测序文库构建并上机测序；对所得数据进行分析得到每个样本中所包含的序列信息。本发明可以高通量长读长完成多样本中混合的多分子的序列检测，提高了HIV的耐药位点的检测效果、效率及准确性。