用于细胞培养基工程化的功能环境学方法

摘要

本发明涉及用于最优化细胞培养基的组成的新方法。该新方法包括两个主要阶段。在第一阶段中，通过执行特定细胞培养方案和外代谢物组测定方案，联合筛选细胞功能和介质因子（medium factor）来建立功能环境学图谱。所述功能环境学图谱由基本细胞功能的强度值相对于介质因子的数据阵列组成。在第二阶段，由所述功能环境学图谱的列（columns）开发最优化的细胞培养基制剂，所述培养基制剂增强或抑制靶标基本细胞功能。该方法的主要优势在于使得能够通过培养基组成操纵进行代谢工程化，其中通过介质因子的操纵来最优化任意高数量的细胞功能，这与主要根据经验而非细胞功能导向的并且需要多得多的实验次数的先前的方法相反。此外，该新方法基于有成本效益的外代谢物组测定且不需要花费巨大的细胞内基因组或蛋白质组学测定。