1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用

摘要

本发明涉及SNP分子标记领域，具体而言，提供了1073个SNP位点在结核分枝杆菌谱系3中的应用。发明人从NCBI数据库获得30个结核分枝杆菌谱系3的全基因组数据，在此基础上进行比对，构建结核分枝杆菌谱系3的进化树后，通过设置Fst系数筛选出最能代表结核分枝杆菌谱系3进化树上每一分枝的共1073个SNP位点。该1073个SNP位点对结核分枝杆菌谱系3的亚谱系判断、菌株水平鉴定和进化分析，甚至是成簇菌株分析都具有重要意义，用于检测这1073个SNP位点的物质及其构成的试剂盒与相关的检测方法都能实现结核分枝杆菌谱系3的亚谱系判断、菌株水平鉴定和进化分析。