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基于融合网络和多打分策略的预后生物标志物识别方法

摘要

本发明公开了一种基于融合网络和多打分策略的预后生物标志物识别方法,为了减小样本异质性的影响,首先对样本的基因表达数据进行标准化和主成分分析,取前两个主成分、用高斯混合模型对样本进行聚类;对于每一类,融合多种生物网络,并从生物功能、预后能力、与已知致病基因相关程度三个角度对网络节点进行打分;通过带重启的随机游走算法,获得网络中节点的重要性排序;根据三种打分方式得到的节点重要性排序值综合评估节点的重要性;分别取每一类排序靠前的基因,合并获得预后生物标志物。本发明能有效识别生物可解释性强、与疾病密切相关并在不同预后样本中显著差异表达的生物标志物,用于疾病样本的预后分析。

著录项

  • 公开/公告号CN110010204A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-07-12

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中南大学;

    申请/专利号CN201910270730.6

  • 发明设计人 李敏;李幸一;王建新;

    申请日2019-04-04

  • 分类号

  • 代理机构长沙正奇专利事务所有限责任公司;

  • 代理人马强

  • 地址 410083 湖南省长沙市岳麓区麓山南路932号

  • 入库时间 2024-02-19 12:18:13

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-08-06

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B40/30 申请日:20190404

    实质审查的生效

  • 2019-07-12

    公开

    公开

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