一种基于全基因组测序检测腺嘌呤单碱基编辑系统脱靶效应的方法及其在基因编辑中的应用

摘要

本发明提供了一种基于全基因组测序检测腺嘌呤单碱基编辑系统(Adenine base editor,ABE)脱靶效应的方法及其在基因编辑中的应用。所述腺嘌呤单碱基编辑系统由TadA:TadA*:Cas9的融合基因和gRNA两部分组分组成。其能催化靶位点处腺嘌呤(Adenine,A)至鸟嘌呤(Guanine，G)的高效置换，在人类疾病基因编辑治疗和疾病模型构建中有广泛的应用前景。为此，我们开发了首个能够检测ABE系统全基因组范围内脱靶效应的检测方法——EndoV‑seq。本发明提供的EndoV‑seq方法在基因编辑，尤其是基因编辑治疗领域，具有广泛的应用前景。