Mapping QTLs for Rice Grain Shape with QTL×Environment Interactions and Epistatic Effects Analysis

摘要

利用广陆矮4号x佳辐占水稻重组自交系构建了SSr标记的遗传图谱.联合2007年和2008年获得的两组稻米粒长(gl)、粒宽(gW)、长宽比(l/W)数据应用混合线性模型方法进行QTl定位,并作加性效应、加性x加性上位互作效应以及加性QTl、上位性QTl与环境的互作效应分析.结果显示;(1)在加性效应分析中两个群体共检测到4个控制粒长的QTl,4个控制粒宽的QTl,5个控制长宽比的QTl,贡献率分别为13.81%、15.36%和16.29%.(2)在上位互作效应分析中两个群体共检测到2对控制粒长的互作QTl,1对控制粒宽的互作QTl,3对控制长宽比的互作QTl,贡献率分别为5.77%、2.59%和7.42%.(3)环境互作检测中,发现共有13个加性QTl和4对QTl的加性x加性上位性与环境产生了互作效应.结果表明,上位性效应和加性效应都影响稻米粒形遗传,QE互作效应也对粒形有着显著的影响.