植物共存細菌の多様性を正しく評価する技術ィノベーション

摘要

植物の表面や内部に生息する細菌（植物共存細菌 と呼ぶ）の多様性を迅速かつ簡便に解析する方法は 未だ確立されておらず，その活用研究は遅れている。とりわけ植物共存細菌のSSU rRNA遺伝子をPCR 増幅して多様性を解析する分子生態学的研究におい ては，宿主植物に由来するオルガネラ（ミトコンド リアおよびプラスチド）の遺伝子が過剰に増幅さ れ，植物共存細菌の多様性が過小評価される重大な 問題が存在する。そこで，この問題に対してブレイ クスル一となり得る新技術，すなわち「PCR過程 においてオルガネラ遗伝子の増幅を抑制する一方で， 植物共存細菌の遺伝子を選択的に增幅する技術」を， Locked Nucleic Acid (LNA)を含むオリゴヌクレオ チド（LNAオリゴ）によるPCRクランプ技術を適 用して開発したので，そのメカニズムと効果につい て紹介する。