近隣剪定法：進化系統樹を利用した配列リサンプリングアルゴリズム

摘要

近年，インフルエンザをはじめ様々な病原体の遺伝子情報が大量に蓄積されつつある．データセットの増大に伴い，配列解析にかかる計算コストが急増している．また，疫学調査活動の差異により，データセットは調査地域や年代に関して大きなサンプリングバイアスを含む．本研究では，進化系統樹を利用してサンプリング密度の高い配列を適宜取り除くリサンプリングアルゴリズムを提案し，その性能を比較実験により評価する．