ィネの品種特異的高精度リフアレンス配列作製手法の開発

摘要

イネ有用変異体の原因遺伝子を特定 する場合、変異体の次世代シーケンスデータ を日本晴リファレンス配列にマツビングし、 変異解析を行うことが一般的である。しかし、この方法では日本晴以外の品種を対象と する場合、品種特異的な領域（日本晴と共通 する配列以外の領域）上の変異を検出するこ とができない。本研究の目的はコシヒカリを モデルとして変異解析のための品種特異的な リファレンス配列を作製することである。そのために比較的少量のPacBio ロングリード 配列を用いて、日本晴リファレンス配列に品 種特異的な配列を付加する手法を開発した。