サツマィモ塊根におけるGWASを用いた着色ゲノム領域の探索

摘要

サツマィモは世界的に重要な農作物種の一 つであるが、同質六倍体や他殖性等の特徴を 持つことにより遺伝的に複雑で、遺伝子の同 定ゃDNAマーカーの開発が非常に困難と なっている。そのため、DNAマーカ一情報を 利用した優良品種の育成、あるいは形質に関 わる遺伝子の同定はほとhど行われていな い。そこで本研究では、サツマィモ栽培品種 (Ioomoea batatas)と近縁ir生Ik (/. trifida) の交配F,集団と栽培品種の自殖S,集団に対 してddRAD-seqを利用した解析を行うこと により効率的に多数のSNPマーカーを開発 しだ。さりにgenome-wide association study (GWAS)により、サツマィモ塊根の着色に関 わる遺伝領域を同定した。