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CRISPR-STOP: gene silencing through base-editing-induced nonsense mutations

机译:CRISPR-STOP:通过碱编辑诱导的废话突变基因沉默

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摘要

CRISPR-Cas9-induced DNA damage may have deleterious effects at high-copy-number genomic regions. Here, we use CRISPR base editors to knock out genes by changing single nucleotides to create stop codons. We show that the CRISPR-STOP method is an efficient and less deleterious alternative to wild-type Cas9 for gene-knockout studies. Early stop codons can be introduced in similar to 17,000 human genes. CRISPR-STOP-mediated targeted screening demonstrates comparable efficiency to WT Cas9, which indicates the suitability of our approach for genome-wide functional screenings.
机译:CRISPR-CAS9诱导的DNA损伤可能对高拷贝数基因组区域具有有害效果。 在这里,我们使用CRISPR基础编辑通过改变单一核苷酸来产生止锁密码子来击倒基因。 我们表明CRISPR-STOP方法是对基因淘汰研究的野生型CAS9有效且不容有害的替代品。 早期的止损密码子可以引入类似于17,000个人基因。 CRISPR-STOP介导的针对性筛选证明了WT CAS9的可比效率,这表明我们对基因组功能筛查的方法的适用性。

著录项

  • 来源
    《Nature methods》 |2017年第7期|共5页
  • 作者单位

    Univ Virginia Sch Med Dept Biochem &

    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

    Univ Virginia Sch Med Dept Biochem &

    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

    Univ Virginia Sch Med Dept Biochem &

    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

    Univ Virginia Sch Med Dept Biochem &

    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

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    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

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    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

    Univ Virginia Sch Med Dept Biochem &

    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

    Univ Virginia Sch Med Dept Biochem &

    Mol Genet Charlottesville VA 22908 USA;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类 生物科学;
  • 关键词

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