KCOMBUを用いた低分子構造比較と予測

摘要

低分子化合物の構造比較は，情報化学（ケモインフォマティクス）のテーマの1つであり，新薬の開発と深い関係がある．生物物理学会の皆さんは，薬とは無縁な方が多いかもしれない．それでも，代謝化合物を調べたり，実験用の試薬やアナログ化合物を選ぶとき，化合物の構造の類似性と機能の類似性について考えることもあるかと思う．また，化合物とタンパク質との相互作用メカニズムを知るため，複合体立体構造を何とかして予測できないかと考えている方もいらっしゃるかもしれない．本稿では，そんなときに役立つはずのプログラムKCOMBU（コンブーと読む）を紹介する．