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けるDNAマーカ一を用いた近交度のばらつき

机译:使用一种DNA标记的亲密关系的变化

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摘要

DNAマーカー情報を近交度評価に利用するため,3世代にわたる実験家系を用い て,親(P)世代におけるマーカー遺伝子型の組み合わせが雑種第2 (F2)世代のホモ型マー カー割合(マーカ一近交度)に与える影響を検討した。71頭のF2世代においてゲノム全体に 分布する364個のマーカーによるマーカー近交度は0.404 ±0.059 (平均士標準偏差)であった。 P世代におけるマーカー遺伝子型の組み合わせにおける平均マーカー近交度は,AAXABが 0.574, A A X BBが0.521,AA X BCが0.376, AB X ABが0.514, AB X ACが0.382およびAB X CDが0.239であった。また,マーカー近交度の頻度分布は二項分布により算出した期待値の 分布と差がなかった。さらに,全マーカーを用いたマーカー近交度とP世代におけるマーカー 遺伝子型の組み合わせにより分類したマーカー近交度との間の相関係数を算出した結果,AA XBC (相関係数0.81), ABXCD (同0.74)およびABXAC (同0.68)の組み合わせで大きかつ た。以上のことから,マーカー近交度は新たな近交度の指標となり得ると考えられた。ただ し,マーカー情報を利用した近交度の評価においてはマーカーの持つ情報量が評価値に影響す ることから,マイクロサテライトマーカーのように対立遺伝子数が多く,多型の程度の高い マーカーを選択する必要があることが示された。
机译:为了使用DNA标记信息进行亲密评估,使用跨越三代的实验家族,父代(P)世代中标记基因型的组合为杂种第二代(F2)的纯合标记率(标记1)检查了对紧密度的影响。在71个F2代中,分布在整个基因组中的364个标记的标记接近度为0.404±0.059(意味着标准偏差)。 P代标记基因型组合中的平均标记接近度对于AAX AB是0.574,对于AAX BB是0.521,对于AA X BC是0.376,对于AB X AB是0.514,对于AB X AC是0.382,对于AB X CD是0.239。它是。另外,标记接近度的频率分布与二项式分布计算出的期望值的分布没有什么不同。此外,由于使用所有标记计算标记紧密度与在P代中按标记基因型组合分类的标记紧密度之间的相关系数,AA XBC(相关系数0.81),ABXCD( 0.74)和ABXAC(0.68)的组合很大。综上所述,认为标记接近度可以是新的接近度指标。但是,在使用标记信息进行亲密性评价时,标记所具有的信息量会影响评价值,因此使用等位基因数量多且多态性高的标记,例如微卫星标记。结果表明您需要做出选择。

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