飢餓環境下におけるトマト苗のタンパク質発現データの配置情報の特徴

摘要

作物が環境から受ける影響の大きさを表す指標を探す試みとして，植物への影響が大きいと考えられる栄養欠乏の影響に嶺、て植物体タンパク質の2次元電気泳動を行った。トマト苗を対象とし，播種，双葉展開後本葉が2枚展開するまでの生育初期は施肥栽培した。 その後，飢餓期として，1ヶ月間無肥料で栽培した。 次に，回復期として2週間再び施肥栽培した。 初期，飢餓期，回復期についてそれぞれ，タンパク質の2次元電気泳動を行い検出されたスポットの点配置パターンおよびスポット数量の分布の特徴を調べた。 その結果，スポットの点配置パターンは初期，飢餓期，回復期のいずれの栄養環境でも規則型を示した。 しかし，スポット数量は栄養環境の違いで，マップ上の位置によって増減が見られた。 分子量方向におけるスポソト数量の分布では，飢餓期の尖度が特に大きかった。 等電点方向におけるスポット数量の分布では，栄養環境が同じ初期と回復期のほうが栄養環境の異なる初期と飢餓期よりもむしろ相関係数が小さかった。