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メタボローム-QTL解析を用いた玄米代謝物組成にかかわる自然変異の探索コメ品質の遺伝的な差をメタボローム分析で探索する

机译:代谢组学-使用QTL分析寻找糙米代谢产物组成中的自然突变通过代谢组分析寻找水稻品质的遗传差异

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摘要

コメはわが国の主食であり,美食家,北大路魯山人を して「うまいものの極致は米なのである.うまいからこ そ毎日食べていられるわけなのである.」(1)と述懐せし めるほど,われわれは米をよく食べ,日々の栄養源とし ている.栄養価が高く食味が良いィネの新品種を作り出すには,イネゲノムの多様な自然変異のなかから,有用 代謝成分の高生産にかかわる変異を同定し,交配育種に より良食味品種へと導入することが近道となる.ィネの形質には,もち/うるち性のように単一遺伝子(Wx)の遺伝型でおおよそ決定される質的形質もある が,おいしさや機能性成分含量などは,複数の量的形質 遺伝子座(Quantitative trait loci ; QTL)の影響を受け る量的形質である.そこで,QTL解析による量的形質 遺伝子座の同定が近年活発化している.有用形質にかか わる遺伝子がィネゲノム上のどこにコードされているの かを特定できれば,DNAマーカーを用いた効率的な有 望個体の選抜が可能となり,育種期間の短縮につなが る.QTL解析を行うには,実験系統群,遺伝型データ, 量的形質データが必要である(2).たとえば組換え自殖系統群は2種類の異なる系統を交配して得た雑種個体を, 数世代にわたって自殖して作成した系統群である.染色 体上のさまざまな領域に組換えが生じることにより,各 系統では交配に用いた二つの系統の染色体が複雑に混じ り合っている.その様子をゲノムワイドに設定した DNAマーカーを用いて解析し,量的形質値と合わせて 解析すると,QTLの染色体上での位置が決定できる. たとえば,竹内らは日本のイネ品種である日本晴とコシ ヒカリから作成した実験系統群総計168系統の飯米の官 能試験データからコシヒカリの良食味に主要な役割を果 たすQTLを第3染色体短腕に見レゝだしている(3).
机译:大米是我们国家的主要食品,我们可以提醒美食家北大路卢山津,“关于美味的最好的食物是大米。因为它很美味,所以我们每天都可以吃。”(1)。很好地食用稻米并将其用作日常营养来源,为了创造具有高营养价值和良好口感的新稻米,在稻米基因组的各种自然突变中,使用了与大量产生有用的代谢成分有关的突变。捷径是确定并引入品味更好的杂交品种,糯性或糯性等水稻性状的质量大致取决于单基因(Wx)基因型。尽管有一些性状,但功能成分的味道和含量是受多个数量性状基因座(QTL)影响的数量性状,因此,通过QTL分析得出数量性状基因座近年来,有用性状的鉴定变得活跃起来,如果能够鉴定与水稻的基因组相关的有用性状的基因在何处编码,则可以利用DNA标记和育种时期有效地选择有前途的个体。为了进行QTL分析,需要实验菌株组,遗传类型数据和定量性状数据(2),例如,重组自体受精菌株组跨越两个不同的菌株。这是一组通过自我繁殖获得的杂种个体数代而产生的品系,由于在色斑上各个区域的重组,每条品系中用于交配的两条品系的染色体很复杂。可以混合使用QTL在染色体上的位置,方法是使用在全基因组范围内设置的DNA标记进行分析,并将其与定量特征值结合起来,从而确定QTL的位置。根据3个染色体的短臂,从由Nihon Haru和Koshihikari水稻品种制备的总共168个水稻和水稻的功能测试数据中发现了QTL,其在越光鸡肉的美味中起主要作用。是(3)。

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