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大規模遺伝子発現情報に基づく遺伝子発見手法の開発

机译:基于大规模基因表达信息的基因发现方法的发展

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摘要

遺伝子の発現プロファイルの類似性は,発 現制御機構や生物学的機能などの推定に有用 な情報をもたらす.従来より,遺伝子間の発現 プロフアイルの類似性を網羅的に把握する上で,階層的クラスタリング手法(HCL)が広 く用いられている.ここで,HCLは,入力デー タの大規模化に伴い,計算処理に膨大な計算 機リソース(計算時間,計算機メモリ一など) を要する.また,二次元平面上(デンド口グラ ムおよびヒートマップ)ですベての遺伝子 - サンプル(実験条件)の発現プロファイルを 視覚化するため,入力データセットの大規模 化に伴い,結果の解釈が困難となる.そこで, 本研究では,これらの諸問題を解決するため に,マイクロアレイ実験データに対する新た な解析手法を確立した.
机译:基因表达谱的相似性为估计表达控制机制和生物学功能提供了有用的信息,从传统上讲,它一直是一个全面了解基因之间表达谱的相似性的层次结构。普通的聚类方法(HCL)被广泛使用,由于输入数据量的增加,HCL需要大量的计算机资源(计算时间,计算机内存等)进行计算处理。另外,由于输入数据集变大,因此难以解释结果,因为所有基因样本的表达谱(实验条件)都在二维平面(齿克和热图)上可视化。因此,在本研究中,为了解决这些问题,我们为微阵列实验数据建立了一种新的分析方法。

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