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Infections du tractus urinaire a pathogenes emergents

机译:新兴病原体的尿路感染

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摘要

Les infections du tractus urinaire (ITU) sont la cause la plus importante d'infections bacteriennes de nos jours avec une incidence annuelle globale aux alentours de 250 millions de cas. Pour memoire, environ 50 % des femmes auront un episode d'ITU dans leur vie. L'etiologie de ces infections a largement ete etudiee durant les dernieres decennies et seules quelques especes bacteriennes sont considerees comme etant de reels uropathogenes (ex. Escherichia coli, Proteus mirabilis, Staphylococcus saprophyticus...). Cependant, l'avenement des nouvelles techniques d'identifications bacteriennes et leurs applications de plus en plus importantes, comme la spectrometrie de masse MALDI-TOF, ou encore l'utilisation de plus en plus aisee du sequen?age entier de genomes, de nombreuses especes bacteriennes prealablement considerees comme des contaminants ou comme appartenant a la flore, sont desormais retrouvees dans les echantillons d'urines, identifiees et etudiees. C'est ainsi que de nouvelles especes uropathogenes ont emerge, comme Actinotignum (anciennement Actinobaculum) schaalii, Aerococcus urinae, Aerococcus sanguinicola ou encore Alloscardovia omnicolens. Ces especes sont souvent peu etudiees et peu connues par la plupart des bacteriologistes et des cliniciens alors que leurs prevalences dans les ITU peuvent être non negligeables chez les patients ages, en cas de predispositions urologiques ou de certaines comorbidites. Ce travail a pour but d'eclaircir les connaissances de la communaute medicale concernant ces nouveaux germes uropathogenes emergents.
机译:尿路感染(UTI)是当今细菌感染的最重要原因,每年的总发病率约为2.5亿例。据记录,大约有50%的女性一生中都会发作一次国际电联。在过去的几十年中,对这些感染的病因进行了广泛的研究,只有极少数细菌被认为是真正的泌尿道致病菌(例如,大肠杆菌,变形杆菌,腐生葡萄球菌...)。但是,新的细菌鉴定技术的出现及其日益重要的应用,例如MALDI-TOF质谱,甚至越来越容易使用的全基因组测序,许多现在,在尿液样本中发现,鉴定和研究了以前被视为污染物或属于菌群的细菌种类。这就是新的尿毒症物种出现的方式,例如放线放线菌(Actinotignum)(原放线放线菌),尿小球菌(Aerococcus urinae),血红球菌(Aerococcus sanguinicola)或什锦变种Alloscardovia omnicolens。大多数细菌学家和临床医生很少对这些种类进行研究,鲜为人知,而在泌尿系统疾病或某些合并症的情况下,老年患者的UTIs感染率不可忽略。这项工作旨在澄清医学界对这些新兴尿毒症病原菌的了解。

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