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【24h】

Aislamiento y caracterización de nuevos marcadores microsatélites para la almeja generosa (Panopea generosa) por medio de secuenciación de nueva generación

机译:通过下一代测序分离和鉴定蛤的新微卫星标记(Panopea generosa)

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摘要

Resumen Antecedentes Panopea generosa es una almeja de gran tama?o, infáunica y longeva con un valor comercial considerable en Canadá, Estados Unidos y México, y de la que se requiere conocer su estructura genética poblacional a lo largo de su rango de distribución. Objetivos Desarrollar nuevos marcadores microsatélites específicos para P. generosa. Métodos En este reporte evaluamos 30 loci microsatélites generados mediante secuenciación genómica de siguiente generación (Illumina Hi-Seq 2500). Resultados Se identificaron a ocho como marcadores genéticos polimórficos adecuados. El número de alelos por locus varió entre 5 y 22, la heterocigosidad observada entre 0.429 y 0.818 y la esperada entre 0.548 y 0.962. Tres marcadores se desviaron del equilibrio de Hardy-Weinberg, después de la corrección de Dunn-?idák, como resultado de un déficit de heterocigosidad, sugiriendo la presencia de alelos nulos y se encontró desequilibrio de ligamiento entre dos microsatélites. Conclusiones Estos marcadores son altamente informativos y útiles para estudios de genética poblacional encaminados a la implementación de medidas de administración y conservación de este valioso recurso.
机译:摘要背景Panopea属是在加拿大,美国和墨西哥具有较大商业价值的蛤in,是长寿命的蛤,它需要了解其分布范围内的种群遗传结构。目的开发新的体育红球菌微卫星标记。方法在本报告中,我们评估了由下一代基因组测序(Illumina Hi-Seq 2500)产生的30个微卫星基因座。结果鉴定出8个合适的多态性遗传标记。每个基因座的等位基因数量在5至22之间,观察到的杂合度在0.429至0.818之间,预期的杂合度在0.548至0.962之间。 Dunn-?Idák校正后,由于杂合性缺陷,三个标记偏离了Hardy-Weinberg平衡,表明存在等位基因无效,并且在两个微卫星之间发现了连锁不平衡。结论这些标记物对旨在为这种宝贵资源实施管理和保护措施的人群遗传学研究提供了非常有用的信息。

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