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EPoS: a modular software framework for phylogenetic analysis

机译:EPoS:用于系统发育分析的模块化软件框架

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摘要

Summary: Estimating Phylogenies of Species (EPoS) is a modular software framework for phylogenetic analysis, visualization and data management. It provides a plugin-based system that integrates a storage facility, a rich user interface and the ability to easily incorporate new methods, functions and visualizations. EPoS ships with persistent data management, a set of well-known phylogenetic algorithms and a multitude of tree visualization methods and layouts. Implemented algorithms cover distance-based tree construction, consensus trees and various graph-based supertree methods. The rendering system can be customized for, say, different edge and node styles.
机译:简介:估计物种系统发育(EPoS)是用于系统发育分析,可视化和数据管理的模块化软件框架。它提供了一个基于插件的系统,该系统集成了存储功能,丰富的用户界面以及轻松整合新方法,功能和可视化功能的能力。 EPoS附带了持久数据管理,一组著名的系统发育算法以及多种树形可视化方法和布局。实施的算法涵盖基于距离的树构建,共识树和各种基于图的超树方法。可以针对不同的边缘和节点样式定制渲染系统。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2008年第20期|p.2399-2400|共2页
  • 作者单位

    Faculty of Mathematics and Computer Science, Friedrich-Schiller-University Jena, 07743 Jena, Germany;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

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