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DiMoVo: a Voronoi tessellation-based method for discriminating crystallographic and biological protein–protein interactions

机译:DiMoVo:一种基于Voronoi镶嵌的方法,用于区分晶体学和生物蛋白质-蛋白质相互作用

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摘要

Motivation: Knowledge of the oligomeric state of a protein is often essential for understanding its function and mechanism. Within a protein crystal, each protein monomer is in contact with many others, forming many small interfaces and a few larger ones that are biologically significant if the protein is a homodimer in solution, but not if the protein is monomeric. Telling such ‘crystal dimers’ from real ones remains a difficult task.
机译:动机:了解蛋白质的低聚状态通常对于理解其功能和机制至关重要。在蛋白质晶体中,每种蛋白质单体彼此接触,形成许多小的界面和一些较大的界面,如果该蛋白质是溶液中的同型二聚体,则具有生物学意义,但如果该蛋白质是单体则不是。从真实的“二聚体”中分辨出来仍然是一项艰巨的任务。

著录项

  • 来源
    《Bioinformatics》 |2008年第5期|652-658|共7页
  • 作者单位

    Department of Structural Biology Fairchild Science Building Stanford University School of Medicine Stanford CA 94305-5126 USA;

    Yeast Structural Genomics IBBMC UMR 8619 batiment 430 Université Paris-Sud 91405 Orsay and;

    LEBS UPR 9063 CNRS 91191 Gif-sur-Yvette France;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

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