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溶液NMR法とX線結晶構造解析によるキトサン結合モジュールとキトサンの相互作用解析

机译:溶液核磁共振法和X射线晶体结构分析法研究壳聚糖结合模块与壳聚糖的相互作用

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摘要

土壌細菌の一種であるPaenibacillus sp. IK5は,触媒モジュール(GH 8)とフィブロネクチンタイプⅢモジュール.2つの糖質結合モジュール(CBM32)からなるモジュラー型キトサナーゼを産生することが知られている.NMRおよび等温滴定型熱量計によるキトサンオリゴ糖の結合実験の結果,これら2つのCBM32(DD1およびDD2)は,高いアミノ酸配列相同性をもつにもかかわらず,キトサンオリゴ糖に対して異なる結合性を示すことがわかった.この結合性の違いを説明するために,DD1とDD2について.溶液NMR構造解析とX線結晶構造解析を行い,キトサンオリゴ糖の結合様式を明らかにした.さらに,部位特異的変異を施したDD1とDD2を用いてオリゴ糖の結合性を調べたところ,両者の結合性の違いは.36番目のアミノ酸残基の相違によるものであることがわかった.
机译:已知一种土壤细菌Paenibacillus sp。IK5会产生模块化的壳聚糖酶,该酶由催化模块(GH 8)和纤连蛋白III型模块组成,两个碳水化合物结合模块(CBM32)。通过等温滴定热量计进行的壳聚糖寡糖结合实验的结果是,尽管这两个CBM32(DD1和DD2)具有很高的氨基酸序列同源性,但它们与壳聚糖寡糖的结合性却有所不同。为了解释结合特性的差异,通过溶液NMR结构分析和X射线晶体结构分析对DD1和DD2进行了分析,并阐明了壳聚糖寡糖的结合方式。当使用已经过的DD1和DD2检查寡糖的结合特性时,发现两者之间的结合特性的差异是由于第0.336个氨基酸残基的差异所致。

著录项

  • 来源
    《応用糖質科学》 |2016年第2期|124-130|共7页
  • 作者单位

    近畿大学大学院農学研究科バイオサイエンス専攻631-8505奈良市中町3327-204,大阪大学蛋白質研究所;

    大阪府立大学生命環境科学研究科応用生命科学専攻599-8531大阪府堺市中区学園町1-1;

    近畿大学大学院農学研究科バイオサイエンス専攻631-8505奈良市中町3327-204;

    福井県立大学生物資源学部生物資源学科910-1195福井県吉田郡永平寺町松岡兼定島4-1-1;

    福井工業大学環境情報学部環境•食品科学科910-8505福井市学困3-6-1;

    産業技術総合研究所バイオメディカル部門305-8566茨城県つくば市東1-1-1;

    近畿大学大学院農学研究科バイオサイエンス専攻631-8505奈良市中町3327-204;

    近畿大学大学院農学研究科バイオサイエンス専攻631-8505奈良市中町3327-204;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 jpn
  • 中图分类
  • 关键词

    キトサン; CBM32; NMR; 結晶構造; 等温滴定型熱量測定;

    机译:キトサン;CBM32;NMR;结晶构造;等温滴定型热量测定;
  • 入库时间 2022-08-17 14:06:36

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