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The complete mitochondrial genome of Eastern paradise fish (Polynemus dubius)

机译:东方天堂鱼(Polynemus Dubius)的完整线粒体基因组

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摘要

Eastern paradise fish, Polynemus dubius (also called P. longipectoralis), lives in rivers of the Southeastern Asia. Although its whole genome is not available, we first obtained its complete mitochondrial genome through next-generation sequencing. The length of its mitochondrial genome is 16 568 bp with 13 protein-coding genes, two rRNA genes, 22 tRNA genes and one control region. The distribution and arrangement of genes in the mitochondrial genome are similar to those of other vertebrates. The GC content is 43.08%, similar to the reported P. paradiseus. A phylogenetic tree was constructed to compare with nine related species by using MEGA 6.0. Through phylogenetic analysis, the relationship of species within the Polynemus genus is determined.
机译:东方天堂鱼,Polynemus Dubius(也称为P. Longipectoralis),住在东南亚的河流中。虽然其全基因组不可用,但我们首先通过下一代测序获得完整的线粒体基因组。其线粒体基因组的长度为16 568bp,具有13个蛋白质编码基因,两个rRNA基因,22个TRNA基因和一个对照区域。线粒体基因组中基因的分布和排列与其他脊椎动物的分布和排列类似。 GC含量为43.08%,类似于报道的P. Paradiseus。构建系统发育树以通过使用Mega 6.0与九种相关物种进行比较。通过系统发育分析,确定了多核属植物内的物种的关系。

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