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【2h】

Prediction of enhancer–promoter interactions using the cross-cell type information and domain adversarial neural network

机译：使用跨细胞类型信息和域对抗性神经网络预测增强剂 - 启动子相互作用

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期刊名称 BMC Bioinformatics
作者
Fang Jing; Shao-Wu Zhang; Shihua Zhang;
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作者单位

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年(卷),期 2020(-1),-1
年度 2020
页码 -1
总页数 16
原文格式 PDF
正文语种
中图分类应用微生物学;生化遗传学;生化药理学;
关键词

机译：增强剂 - 启动子相互作用;细胞系;卷积神经网络;转移学习;梯度逆转层;
入库时间 2022-08-21 12:06:17

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机译：图1：用于：（a）区域的长距离触点的可视化示例，这里增强了来自人胎儿脑细胞的两个10kb分辨率的Hi-C地图。从兴趣点计算联系人高达30个距离距离。顶部到底：jbrowse（Skinner等，2009）截图，具有基因和互动曲线表示（绿色兴趣点，它们的黄色接触预测）; HICENTERPLISE交互配置曲线图具有强度（由距离加权）和FDR校正的P值（Q值）的-LOG10，其阈值设置为0.01。（b）TADS，这里是来自Huvec的第17次染色体的150 KB分辨率Hi-C地图的Hicenterprise可视化。左上三角：原版Hi-C地图接触频率;右下三角形：跨度相互作用的Q值的-log10计算，使用超几何分布计算。
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