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Approximation Bayesian Computation

机译:近似贝叶斯计算

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摘要

Approximation Bayesian computation [ABC] is an analysis approach that has arisen in response to the recent trend to collect data that is of a magnitude far higher than has been historically the case. This has led to many existing methods become intractable because of difficulties in calculating the likelihood function. ABC circumvents this issue by replacing calculation of the likelihood with a simulation step in which it is estimated in one way or another. In this review we give an overview of the ABC approach, giving examples of some of the more popular specific forms of ABC. We then discuss some of the areas of most active research and application in the field, specifically, choice of low-dimensional summaries of complex datasets and metrics for measuring similarity between observed and simulated data. Next, we consider the question of how to do model selection in an ABC context. Finally, we discuss an area of growing prominence in the ABC world, use of ABC methods in genetic pathway inference.
机译:近似贝叶斯计算[ABC]是一种响应近来收集数据的趋势而出现的分析方法,该趋势的数量级远高于历史情况。由于计算似然函数的困难,这导致许多现有方法变得棘手。 ABC通过用模拟步骤替换可能性的计算来避免此问题,在该模拟步骤中,以一种或另一种方式进行估计。在本文中,我们概述了ABC方法,并举例说明了一些更流行的ABC特定形式。然后,我们讨论该领域中最活跃的研究和应用程序的某些领域,特别是选择复杂数据集的低维摘要以及用于度量观测数据和模拟数据之间相似性的度量。接下来,我们考虑如何在ABC环境中进行模型选择的问题。最后,我们讨论了ABC世界中一个日益重要的领域,即在遗传途径推断中使用ABC方法。

著录项

  • 期刊名称 other
  • 作者

    Paul Marjoram;

  • 作者单位
  • 年(卷),期 -1(1),3
  • 年度 -1
  • 页码 853
  • 总页数 9
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种
  • 中图分类
  • 关键词

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