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LICHEM: A QM/MM Program for Simulations with Multipolar and Polarizable Force Fields

机译:LICHEM:QM / MM程序用于多极性和极化力场的仿真

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摘要

We introduce an initial implementation of the LICHEM software package. LICHEM can interface with Gaussian, PSI4, NWChem, TINKER, and TINKER–HP to enable QM/MM calculations using multipolar/polarizable force fields. LICHEM extracts forces and energies from unmodified QM and MM software packages to perform geometry optimizations, single–point energy calculations, or Monte Carlo simulations. When the QM and MM regions are connected by covalent bonds, the pseudo-bond approach is employed to smoothly transition between the QM region and the polarizable force field. A series of water clusters and small peptides have been employed to test our initial implementation. The results obtained from these test systems show the capabilities of the new software and highlight the importance of including explicit polarization.
机译:我们介绍LICHEM软件包的初始实现。 LICHEM可以与高斯,PSI4,NWChem,TINKER和TINKER-HP交互作用,以启用使用多极/极化力场的QM / MM计算。 LICHEM从未经修改的QM和MM软件包中提取力和能量,以执行几何优化,单点能量计算或蒙特卡洛模拟。当QM和MM区域通过共价键连接时,采用伪键合方法在QM区域和极化力场之间平稳过渡。一系列水簇和小肽已被用于测试我们的最初实现。从这些测试系统获得的结果显示了新软件的功能,并强调了包括显式极化的重要性。

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