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QTL Mapping of Adult-Plant Resistance to Leaf Rust in the Wheat Cross Zhou 8425B/Chinese Spring Using High-Density SNP Markers

机译:利用高密度SNP标记的小麦周8425B /中国春成株抗叶锈病的QTL定位

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摘要

Wheat leaf rust is an important disease worldwide. Growing resistant cultivars is an effective means to control the disease. In the present study, 244 recombinant inbred lines from Zhou 8425B/Chinese Spring cross were phenotyped for leaf rust severities during the 2011–2012, 2012–2013, 2013–2014, and 2014–2015 cropping seasons at Baoding, Hebei province, and 2012–2013 and 2013–2014 cropping seasons in Zhoukou, Henan province. The population was genotyped using the high-density Illumina iSelect 90K SNP assay and SSR markers. Inclusive composite interval mapping identified eight QTL, designated as QLr.hebau-2AL, QLr.hebau-2BS, QLr.hebau-3A, QLr.hebau-3BS, QLr.hebau-4AL, QLr.hebau-4B, QLr.hebau-5BL, and QLr.hebau-7DS, respectively. QLr.hebau-2BS, QLr.hebau-3A, QLr.hebau-3BS, and QLr.hebau-5BL were derived from Zhou 8425B, whereas the other four were from Chinese Spring. Three stable QTL on chromosomes 2BS, 4B and 7DS explained 7.5–10.6%, 5.5–24.4%, and 11.2–20.9% of the phenotypic variance, respectively. QLr.hebau-2BS in Zhou 8425B might be the same as LrZH22 in Zhoumai 22; QLr.hebau-4B might be the residual resistance of Lr12, and QLr.hebau-7DS is Lr34. QLr.hebau-2AL, QLr.hebau-3BS, QLr.hebau-4AL, and QLr.hebau-5BL are likely to be novel QTL for leaf rust. These QTL and their closely linked SNP and SSR markers can be used for fine mapping, candidate gene discovery, and marker-assisted selection in wheat breeding.
机译:小麦叶锈病是世界范围内的重要疾病。种植抗病品种是控制该病的有效手段。在本研究中,在河北省保定市和2012年的2011-2012年,2012-2013年,2013-2014年和2014-2015年种植季,对来自周8425B /中国春交的244个重组自交系的叶锈病严重程度进行了表型分析。河南省周口市–2013年和2013–2014年的种植季节。使用高密度Illumina iSelect 90K SNP分析和SSR标记对人群进行基因分型。包含性复合间隔映射确定了八个QTL,分别命名为QLr.hebau-2AL,QLr.hebau-2BS,QLr.hebau-3A,QLr.hebau-3BS,QLr.hebau-4AL,QLr.hebau-4B,QLr.hebau- 5BL和QLr.hebau-7DS。 QLr.hebau-2BS,QLr.hebau-3A,QLr.hebau-3BS和QLr.hebau-5BL来自Zhou 8425B,而其他四个来自中国春。 2BS,4B和7DS染色体上的三个稳定QTL分别解释了表型变异的7.5–10.6%,5.5–24.4%和11.2–20.9%。 Zhou 8425B中的QLr.hebau-2BS可能与Zhoumai 22中的LrZH22相同; QLr.hebau-4B可能是Lr12的残余电阻,而 QLr.hebau-7DS Lr34 QLr.hebau-2AL QLr.hebau-3BS QLr.hebau-4AL, QLr.hebau-5BL 可能是用于叶片防锈的新型QTL。这些QTL及其紧密相连的SNP和SSR标记可用于小麦育种中的精细作图,候选基因发现和标记辅助选择。

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