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Individual-based approach to epidemic processes on arbitrary dynamic contact networks

机译:任意动态联系网络上基于个体的流行病处理方法

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摘要

The dynamics of contact networks and epidemics of infectious diseases often occur on comparable time scales. Ignoring one of these time scales may provide an incomplete understanding of the population dynamics of the infection process. We develop an individual-based approximation for the susceptible-infected-recovered epidemic model applicable to arbitrary dynamic networks. Our framework provides, at the individual-level, the probability flow over time associated with the infection dynamics. This computationally efficient framework discards the correlation between the states of different nodes, yet provides accurate results in approximating direct numerical simulations. It naturally captures the temporal heterogeneities and correlations of contact sequences, fundamental ingredients regulating the timing and size of an epidemic outbreak, and the number of secondary infections. The high accuracy of our approximation further allows us to detect the index individual of an epidemic outbreak in real-life network data.
机译:接触网络的动态变化和传染病的流行通常发生在可比较的时间尺度上。忽略这些时标之一可能无法完全了解感染过程的种群动态。我们为适用于任意动态网络的易感感染恢复的流行病模型开发了基于个体的近似方法。我们的框架在个体级别上提供了与感染动态相关的随时间变化的概率流。这种计算有效的框架丢弃了不同节点状态之间的相关性,但在近似直接数值模拟时提供了准确的结果。它自然地捕获了接触序列的时间异质性和相关性,调节流行病爆发时间和规模的基本要素以及继发感染的数量。近似值的高准确性进一步使我们能够检测现实网络数据中流行病暴发的索引个体。

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