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Mind the dbGAP: The Application of Data Mining to Identify Biological Mechanisms

机译:注意dbGAP:数据挖掘在识别生物学机制中的应用

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摘要

Scientists have discovered basic mechanisms of mammalian development and disease through studying diverse animal models and human Mendelian disorders. The recently constructed database of Genotypes and Phenotypes (dbGAP) has made available to the scientific community extensive human genetic data from large, well-characterized phenotypes. Here we discuss how, in our view, the availability of dbGAP data has changed the traditional scientific approach to the identification of the genetic contributors to human disease and traits. Further, dbGAP has created new opportunities to discover genes important for mammalian development and disease traits through the targeted analysis of coding variants and the application of pathway-based approaches.
机译:科学家通过研究各种动物模型和人类孟德尔疾病,发现了哺乳动物发育和疾病的基本机制。最近建立的基因型和表型数据库(dbGAP)已为科学界提供了来自大型,特征明确的表型的广泛人类遗传数据。在这里,我们讨论了我们认为dbGAP数据的可用性如何改变了传统的科学方法来识别人类疾病和性状的遗传因素。此外,dbGAP通过针对编码变体的靶向分析和基于途径的方法的应用,为发现对哺乳动物发育和疾病特征重要的基因创造了新的机会。

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