乌鲁木齐市猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2基因遗传变异分析

摘要

为研究新疆乌鲁木齐市猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株Nsp2基因的遗传变异情况.采用RT-PCR方法扩增了3份PRRSV阳性样品的Nsp2基因,并应用DNAStar和Mega6.0等软件对所得Nsp2基因序列进行多重序列比对和遗传进化分析.3株PRRSV的Nsp2序列均存在30个氨基酸的不连续缺失,与以JXA1为代表的高致病性蓝耳病(HP-PRRSV)在同一小分支,同源性在98.6％～99.0％之间,与经典毒株VR-2332的同源性在84.0％～84.2％之间,与欧洲株LV同源性仅为49.5％ ～ 49.7％.表明HP-PRRSV已成为乌鲁木齐市的优势流行毒株,本分离株与HP-PRRSVJXA1株亲缘关系较近,与经典毒株VR-2332株亲缘关系较远.本研究为掌握乌鲁木齐市的PRRSV分子流行病学特征及科学防控奠定了基础.