2013-2014年我国东北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5和NSP2基因遗传变异分析

摘要

为了解2013-2014年我国东北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异情况,研究对东北地区3个省份29个地区采集的123份样品进行了检测,并对20份阳性样品的GP5和部分NSP2基因进行了RT-PCR扩增、测序、遗传进化及序列比对分析.结果表明:我国东北地区PRRSV阳性率为16％,与国内外已发表的10株PRRSV参考株相比,GP5基因的核苷酸同源性为84.4％ ～ 100％.GP5氨基酸序列分析表明,大多数毒株在氨基酸高变区、中和表位和诱导表位发生了变异,主要变异为:C24→ Y24,F25→L25,V27→A27,L28→I28,N34→ G34/S34/D34.LN283株GP5和NSP2基因遗传进化树的不同结果表明,LN283株可能涉及PRRSV基因重组.HLJ13株NSP2基因PCR扩增产物有2条相差90 bp的目的条带,且NSP2基因遗传进化树显示两条序列分别属于CH-1a亚群和HuN4亚群,推断HLJ13株可能为经典和高致病性混合感染株.GP5和NSP2遗传进化及氨基酸序列分析结果表明,所有病毒株均属于北美洲型,且以HP-PRRSV为主,经典株与变异株共存.本研究结果可为我国东北地区PRRSV遗传进化研究及疫病防控提供参考.