水貂FGF5基因多态性及其与毛长性状的关联分析

摘要

本研究旨在检测水貂成纤维细胞生长因子5 (fibroblast growth factor 5,FGF5)基因多态性,解析该基因变异位点与水貂毛长性状的相关性.首先对30只美国短毛黑水貂的FGF5基因部分序列进行了扩增和测序;使用DNAMAN软件分析发现,FGF5基因内含子1中T376C位点存在多态性位点;通过在线酶切软件NEBcutter V2.0分析表明,TaqI内切酶可用于该SNP位点基因分型.以美国短毛黑水貂和丹麦咖啡水貂共计252个血液样本的基因组DNA作为模板,采用PCR-RFLP技术对252只美国短毛黑水貂和丹麦咖啡水貂FGF5基因T376C位点进行了基因分型,并将该位点与水貂毛长性状进行关联分析.结果 表明:PCR扩增片段在376位点存在突变,该位点存在2个等位基因T和C,形成TT、TC和CC 3种基因型,该变异位点在美国短毛黑水貂群体中为中度多态(0.25＜PIC＜0.05),而在丹麦咖啡水貂群体中表现为高度多态(PIC＞0.25);x2检验结果显示,T376C位点在美国短毛黑水貂群体处于Hardy-Weinberg平衡状态,在丹麦咖啡水貂群体显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态;关联分析表明,FGF5基因T376C位点与水貂毛长性状极显著相关(P＜0.000 1).研究结果提示,FGF5基因T376C位点可能是影响水貂毛长性状的主控位点,可作为水貂毛长性状潜在的分子遗传标记.