江豚线粒体Cyt b和D-loop片段序列分析及其分子系统学研究

摘要

对江豚(Neophocaena phocaenoides) mtDNA的Cyt b(377 bp)和D-loop(343 bp)片段进行了测序和分析,并与GenBank中鼠豚类及一角鲸类同源序列进行了比较.研究结果表明,Cyt b基因片段的碱基组成平均为T:29.0%,C:28.8%,A:27.2%,G:15.0%;D-loop片段的碱基组成平均为T:35.9%,C:21.8%,A:32.4%,G:9.9%.Cyt b基因片段共出现109个变异位点,简约信息位点107个,序列变异度为28.9%,碱基替代主要发生在密码子第3位点上,转换/颠换为13.3;D-loop片段共有109个变异位点,简约信息位点100个,序列变异度为31.8%,转换/颠换为2.4.构建的系统发育树显示,江豚是鼠豚科中较早分化出来的一个类群,与一角鲸科的亲缘关系最近.2个片段序列的分析结果一致,棘鳍鼠海豚Phocoena spinipinnis、太平洋鼠海豚P.sinus和黑眶鼠海豚Australophocaena dioptria聚为一支.