香椿(Toona sinensis)微卫星富集文库构建及特性分析

摘要

采用Dynal磁珠富集法构建了香椿微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析.实验使用改良CTAB法提取香椿基因组DNA,用(AC)8、(AG)8和(ATG)123种带有生物素标记的探针与香椿基因组DNA的酶切片段进行杂交,将磁珠捕获的含有微卫星序列的DNA片段插入pMD 18-T载体,并转入感受态细胞Trans 5α构建克隆,经筛选后得到含356个克隆的香椿基因组微卫星富集文库.从富集文库中挑选插入片段长度为400 ～ 800 bp的128个克隆进行测序,其中含有SSR的序列77条,得率达60.16％,其中完美型占82.69％,非完美型8.65％,混合型8.65％.上述结果为SSR位点的进一步开发奠定了基础.