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地黄微卫星富集文库构建及特性分析

         

摘要

应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(AC)8,(AG)8和(ATG)12与地黄基因组DNA酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD 18-T栽体上,转入感受态细胞Trans 5 α,构建地黄富集微卫星文库.利用M13F和M13R载体序列引物筛选文库,对插入片段长度为400~ 800 bp的克隆进行测序.共获得96条序列,48条(50%)含有微卫星位点,其中完美型占66%,非完美型22%,混合型12%.微卫星重复基元中,二核苷酸(AG)n和三核苷酸(CAT)n最为常见.

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