牛冠状病毒陕西流行株N和HE基因序列分析及编码蛋白分子特征预测

摘要

为了解牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)陕西流行株的N和HE基因的遗传变异情况及分子结构特征,便于以后制备检测抗原.利用GenBank收录的BCoV参考株的N和HE基因序列,设计合成特异性PCR引物,以陕西省某牛场BCoV阳性样本基因组为模板,分别对N和HE基因进行扩增、测序、序列分析及预测编码蛋白分子特征.结果表明,成功克隆了BCoV陕西流行株的N和HE全基因序列;核苷酸序列分析表明,陕西流行株N基因与国内外已报道的BCoV核苷酸同源性在98.38％～99.54％之间,HE基因核苷酸同源性在97.01％～98.09％之间.研究结果为BCoV陕西流行株分子生物学特性研究提供基础资料,为进一步研制BCoV抗体ELISA检测方法奠定基础.