南阳黄牛TLR2基因扩增及序列分析

摘要

根据GenBank中发表的牛TLR2基因序列设计引物,通过PCR方法对南阳黄牛的TLR2基因进行分段扩增并测序,拼接后得到包含TLR2完整编码区以及5’端和3’端非编码区的2399 bp的全序列.序列分析结果表明,南阳黄牛TLR2基因开放阅读框全长2 355 bp,共编码784个氨基酸.南阳黄牛的TLR2基因编码区与荷斯坦牛的相比发生了16个碱基突变,其中9个发生在胞外区,2个发生在跨膜区,5个发生在胞内区,没有引起氨基酸的改变.与GenBank已发表的其他动物TLR2基因参考序列进行比较,结果显示南阳黄牛与荷斯坦牛、野牛、水牛、山羊、绵羊、猪、大猩猩和人的同源性分别为99.3％、99.3％、98.0％、96.3％、95.5％、85.4％、83.2％和83.1％.TLR2 N末端存在信号肽且可能在21位氨基酸处存在裂解位点,蛋白分子结构预测TLR2蛋白含1个跨膜结构域.