鸭源鸡杆菌外膜蛋白W基因扩增及序列分析

摘要

为了解不同鸭源鸡杆菌菌株外膜蛋白W基因(ompW)的差异性,对不同地域32株鸭源鸡杆菌ompW基因进行扩增、测序,并应用DNAstar/MegAlign和MEGA.5.05软件对其进行比对及遗传进化分析.结果表明:ompW基因存在于所有检测的鸭源鸡杆菌中.全长在630～711 bp,编码209～236个氨基酸.与参考株UMN179的ompW核苷酸同源性为88.7％～100％,氨基酸同源性为86.7％～99.6％.不同来源的鸭源鸡杆菌的核苷酸同源率为84.1％～100％,氨基酸同源性为78.7％～99.6％.进化树分析表明,鸭源鸡杆菌ompW序列差异与分离地理位置,毒力无明显的相关性.