快速提取肠道微生物基因组DNA的方法

摘要

目的:肠道微生物的研究日益成为热点,如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键.本文通过对酚/氯仿法提取总DNA过程进行考察和优化,建立一种简便酚/氯仿抽提法.方法:考察和优化酚/氯仿法提取总DNA的过程,并根据DNA产量、纯度以及ERIC-PCR及16S rNDA-RFLP所反映的微生物群落结构特性的指标,并与QLAamp?DNAStoo1 Mini Kit提取的进行比较,评价了所建立的快速提取方法.结果:用简便酚/氯仿法得到基本完整的基因组DNA,ERIC-PCR和16S rDNA-RFLP结果与QIAamp?DNA Stool Mini Kit法基本相同.结论:该方法快速并成本低,适合肠道微生物研究中总DNA提取,尤其适合处理大批量的样品.